同治帝親自主持朝政以後，一年以內，倒也不敢懈怠，全都用心處理。只是他的性格很剛強，和慈禧太后很相似。慈禧太后雖然已經把政權交出去了，但遇到有些軍國大事，仍然讓太監秘密打探，打探以後，就會把同治帝叫去批評一頓，問他為什麼不來報告。偏偏同治帝也很倔強，心想母后已經把政權交給我了，為什麼還來干涉？母后讓他稟報，他就更加隱瞞，因此母子之間，反而產生了矛盾。

只有慈安太后靜養深宮，什麼事都不問，而且每次同治帝去拜見的時候，總是和顏悅色，沒有心情不好的時候。同治帝因為她和藹可親，所以經常去拜見，跟自己的親孃反而變得生疏了。

慈禧太后更加不高興了，有時候就把皇后叫去，命令她勸勸同治帝。皇后雖然連連答應，但心裡卻跟同治帝的心思差不多。花前月下，私語喁喁，竟然把慈禧太后所說的話全部告訴了同治帝，惹得同治帝更生氣了。背後說話，難免有疏漏，訊息傳到了慈禧太后耳裡，索性遷怒於皇后，恨她恨得咬牙切齒。

同治帝也心情不好，太監文喜、桂寶等人就想替同治帝解憂，於是慫恿同治帝重建圓明園。這個建議正中同治帝的下懷，自然立刻批准，接著就命令總管內務府選好日子儘快開工。下達的命令裡面卻說是預備讓兩宮皇太后用來休息的，以方便頤養天年，自己也算盡一下孝。其實暗地裡打的算盤和當年咸豐帝是一樣的。

只有恭親王奕訢關心國家大事，暗想國家已經出現財政赤字了，還怎麼能大興土木呢？於是就進諫同治帝，請他停止。同治帝一番高興，被老頭兒出來這麼一囉唆，心裡很不自在。恭親王奕訢仍然嘮嘮叨叨，拿古往今來的好皇帝來勸說，說要怎麼節儉，要怎麼勤勞，說個沒完。結果惹得同治帝暴跳如雷，就說：「修建圓明園，就是為了讓兩宮太后享享清福。我記得孟子說過：‘尊親之至，莫大乎以天下養。’我現在建造個小園子，就是為了奉養兩位太后，叔叔卻說這樣做不好，我還真是不信了。」奕訢還想再勸說，同治帝怒形於色，站起來一甩袖子，走到裡面去了。奕訢只好退出來。

事有湊巧，奕訢剛退出宮門，他兒子載澂就進宮來見同治帝了。載澂曾在宏德殿伴讀，自小就跟同治帝關係不錯，等到同治帝親政，退朝有閒暇的時候，經常讓載澂自由出入宮裡，聊天解悶。這天載澂求見，太監急忙報告了同治帝，偏偏同治帝不讓他進去。

載澂莫名其妙，仍舊像平時一樣開玩笑，說：「皇上平時非常豁達，怎麼今天擺起架子來了？」說完，揚長而去。太監就把載澂說的話全部報告了。

同治帝大怒說：「他老子剛剛來嘚瑟了一把，沒想到他又過來嘚瑟。他說我擺架子，我就擺給他看。」

於是立刻宣召軍機大臣、大學士文祥進見。文祥奉旨進去，同治帝說：「恭王奕訢對我無禮，他兒子載澂更加不像話，我打算將他們倆全都賜死，叫你進來草擬個命令。」

文祥不聽不要緊，一聽這個命令，連忙跪下，只是不停地磕頭。同治帝說：「你幹什麼？」

文祥說：「恭、恭親王奕、奕訢一向勤勞認真，就算他犯了罪，也懇求皇上赦免他！」

同治帝冷笑一聲說：「我明白了！你們都是他的黨羽，所以事事維護他。」

文祥又磕了幾個頭，隨口回答說：「奴才不、不敢。」

同治帝又說：「如果讓他死有點太重的話，那就把他的官職罷免了。」

文祥到這個地步也不敢再違抗命令，就馬馬虎虎地弄了份命令。同治帝看完以後，點了點頭，就說：「你把這份命令拿去，明天就照著這份命令宣佈吧！」

文祥接旨退出，也不回府，一路跑到恭親王家裡，秘密通報了恭親王。恭親王也很著急，急忙找來幾個心腹商量。三個臭皮匠頂個諸葛亮，一面由文祥趕緊報告了慈禧太后，一面由御史沈淮、姚百川出面寫了一份報告，報告說：「皇上打算修建圓明園，奉養兩位太后，這是以孝治天下的楷模，但圓明園自從被毀掉以後，所有的景觀都被毀掉了，不如三海名勝，就在皇宮裡，讓人修建，也能很快修好。」

報告剛寫好，文祥已經從宮裡面出來，回去報告了恭親王。他報告說：「草擬的命令已經交給了西太后，大概能逃過一劫。」恭親王這才稍稍放心。

第二天，沈、姚兩御史又把報告交上去。同治帝看到「便於修建的時候」，這才有些回心轉意，當下就命令內閣草擬了道命令，當天宣佈說：

「上次下命令讓總管內務府大臣修建圓明園工程，選好日子儘快開工，本來是為了讓兩位太后頤養天年，我自己也能稍微盡一下孝。

「今年開工以後，聽說工程量浩大，而且不是一時半會兒就能修建好的，現在國家財政艱難，經費不足，軍事工作還沒有搞好，各省也經常遭遇一些自然災害。我想到這些，就不打算大興土木，來增加老百姓的負擔了，所有圓明園的工程，現在全部停止，等以後國家太平，國庫充裕時，再修建好了。

「因為想到三海就在皇宮旁邊，樓閣堅固，稍微進行下修理，工程也不是很大，所以就讓有關大臣去檢視一下三海的情況，具體怎麼修理，拿出一個完整的規劃方案報告上來。」

過了幾天，同治帝上朝，正趕上恭王奕訢也跟著大夥兒一塊兒朝見，剛好被同治帝瞧見，官職、官服照舊，不由得詫異起來。退朝後，立刻召見文祥，問他上次已經下令把守恭親王的官職給撤免了，怎麼他一點事兒沒有？

文祥沒什麼可以辯解的，就把問題推到西太后一個人身上，說：「西太后聽說了這件事，就把命令取消了，所以恭親王才官照當，官服照穿。」

同治帝憤怒地說：「我既然已經親政了，你們就應該按照我的命令辦事，你們就知道有我娘，難道不知道有我嗎？」接著把文祥臭罵一頓，讓他滾出去，立刻拿起硃筆，寫了幾行，讓太監通知大臣們：

傳令在朝廷的各位親王大臣，我從去年正月二十六日親政以來，每次召見恭親王，他說話之間，有很多失禮的地方，特此罷免他親王的職務，也不能繼承了。現在就降級為郡王，仍然留在軍機處辦公。還有載澂也罷免貝勒郡王的頭銜，算是小小的懲罰。

這道命令剛頒佈，沒出幾個小時，西太后那裡，奕訢和文祥已經進去哭訴了。西太后安慰了他們一番，接著把同治帝叫去訓斥了一頓，讓他把恭親王父子的官職還回去。氣得同治帝啞口無言，只好退出去，第二天又下了一道命令：

我奉慈安端裕康慶皇太后、慈禧端祐康頤皇太后命令，昨天降旨將恭親王革去親王官職，不能繼承，降級為郡王，並且撤免了載澂貝勒郡王的頭銜，恭親王每次彙報工作的時候，說話衝撞，本來罪有應得。

但看在他自從輔政以來，多少有些功勞的分上，所以現在就讓他官復原職，連載澂的貝勒郡王頭銜也一起賞還。希望他以後能深切體會朝廷的深意，引以為戒，銳意任難，不要辜負我的期望。

自從有了這道命令以後，同治帝接連好多天都心情不爽。文喜、桂寶就又想了一個辦法，勸說同治帝微服私訪。同治帝的命就要斷送在他們倆人手裡了。

北京的八大胡同以前一直是娼妓聚居的地方，花天酒地，朝廷也不管。同治帝聽了文喜、桂寶的話，就帶著他們兩人，微服出遊，到了妓院，發現享受人生樂事果然跟宮裡大不一樣。妓女一個個生得無比妖豔，眉挑目語，無非賣弄風騷，淺透輕顰，隨處惹人憐惜。開瓊筵以坐花，飛羽觴而醉月。燈紅酒綠，玉軟香溫。既而玉山半頹，海棠欲睡，羅襦半解，薌澤先融，衣釦輕鬆，柔情慾醉。描不盡的媚態，說不完的綢繆。唯願終老此鄉，其他皆非樂土！

當時內務府裡有一個忠心耿耿的滿族官員，名叫桂慶，因為同治帝年輕好色，害怕皇帝活不長，就請求把蠱惑的太監全部開除。至於罪魁禍首，應該立刻殺掉。請求皇太后保護皇上，千萬不要讓他沉溺於聲色之中。話說得非常真摯懇切，但同治帝不願意聽，就連西太后也不願意聽。西太后是什麼用心？大概是為了偏袒太監吧。

桂慶一看勸說不動，就辭職回家了。從此，同治帝每天晚上出去尋歡作樂，逍遙快活。到了第二天早上，大臣們都上朝了，他還沒有返回宮。恭親王以下都已經聽說了，但因為上次圓明園的事，誰也不敢再勸說，只是暗地裡報告了慈禧太后。慈禧太后也批評了幾次。

但因為同治帝一直不聽，惹惱了慈禧太后，索性完全不管不問了，只是朝廷的大事讓恭親王等人格外留心。同治帝更愜意了，恰好趕上西太后四十歲生日，總算在宮裡住了兩天，也照舊慶賀了一下。

這年沒什麼重要的情況，只是跟中國通商的日本國中的小田縣民和琉球國的漁民，因為航行在海上，遇到風漂到了臺灣，被當地人給殺了。日本派人來詰責，清政府就說臺灣地區的情況自己一直都不過問。日本就派中將西鄉從道率兵趕到臺灣，攻擊當地居民。

福建省船政大臣沈葆楨和藩司潘蔚趕往臺灣查辦，說臺灣是中國領土，日本不能動用武力。西鄉從道哪肯答應？而且說琉球是他的保護國，所有被殺的漁民都要中國賠償。

沈葆楨於是就寫信給河北總督李鴻章，請他調派十三營，趕赴臺灣防守。日本看到臺灣的防禦逐漸牢固，就又派專使大久保利通趕到京城，跟總理衙門交涉。當時由英使威妥瑪居中調停，讓中國拿出十萬兩白銀，軍費賠款四十萬兩白銀，這才算了事，日本兵退出臺灣。其實琉球一直就是中國的領土，不是日本的保護國，清政府只是讓日本退兵就完了，對於這些事卻都沒有申明。