天津的宗教案才剛剛了結，兩江總督馬新貽又被刺殺了。朝廷任命李鴻章為河北總督，把曾國藩調去擔任兩江總督。這年曾國藩正好六十歲生日，朝廷送了他一塊「勳高柱石」的匾，「福」字、「壽」字各一個，梵佛銅像一尊，玉如意一柄，蟒袍一件，還有其他一些零碎東西。
曾國藩去朝廷答謝，慈禧太后詢問了一下天津的情況，然後讓他迅速趕赴江南。曾國藩一一應答，隨後退出，就在同治九年十月離開京城，一路上沒事兒，到南京接管了所有的行政工作。
清政府的上一屆總督被人刺殺，事關重大，於是就命令欽差鄭敦謹南下，一塊兒審問這起案件。招集了中軍官、旗牌官、巡捕官、王命司、護印司、護勅司、刀斧手、捆綁手、劊子手、洋槍隊、馬刀隊、鋼叉隊，弄得密密麻麻，場面壯觀。曾國藩和鄭敦謹一塊兒審問，讓人把兇犯張汶祥帶上來。兩邊的衙役一聲吆喝，就把張汶祥給推上來了，曾、鄭兩人先是恐嚇，後是動用刑罰。
但這張汶祥毫無實供，只是說刺死馬新貽，就可以消消心裡的火，現在大事已了，願意立刻受死。曾國藩又問他是什麼人指使的，他就大喊說：「要刺殺馬新貽的是我，把馬新貽刺殺的也是我，我好漢做事好漢當，任憑你們處治就行了。」鄭欽差還想引誘騙供，他索性說指使他的人，就是你們。弄得曾、鄭二人無計可施，只好報告說：「這名兇犯沒有人指使，應該處以極刑。」朝廷批准請求，這名罪犯就被凌遲處死。
張汶祥這傢伙到底為了什麼事，去刺殺馬新貽？這個我們也無從考證。但據說，馬新貽還沒有發達的時候，曾經跟一個結義兄弟非常莫逆。後來那個結義兄弟娶了一位漂亮老婆，長得杏眼梅腮，嫵媚動人，他看在眼裡，羨慕得不得了。一時半會兒勾搭不上，日思夜想，差點弄出單相思病。
馬新貽在官場很混得開，是個投機鑽營的好手，從縣官開始當起，一路穩升，沒幾年時間就當上了總督。當上總督以後，有了權力就可以胡作非為了。馬新貽外表裝出一副情深意重的樣子，立刻把他結義兄弟提拔，派他到外地辦公，又讓他把家屬搬到衙門，說是方便照顧，讓他安心去辦事就行了。他結義兄弟感謝不盡，急忙把家屬安頓在總督衙門裡。
馬新貽早就擺好了迷魂陣，不怕勾搭不上別人的老婆。他結義兄弟的老婆畢竟是女人，對這種迷魂藥還沒有免疫力，一到了衙門，就被灌得爛醉，然後抱進寢室，寬衣解帶，無所不至。等到醒來，已經生米煮成熟飯了。馬新貽又使出渾身手段，女人嘛，多多少少有些勢利眼，暗想馬新貽是現任總督，比自己的丈夫要有錢有勢，又加上脾氣和相貌也比自己的丈夫要強一些。事情已經到了這一步，索性任由他擺弄，自己也樂得快活。後來馬新貽更加寵愛，她也更加柔媚。天長地久有時盡，此情綿綿無絕期，真是天造地設的一對姦夫淫婦。
一年又一年，她丈夫惹動兒女情腸，多次寫信請假，馬新貽不但不批准，還秘密下達了一封檔案，給他辦事地方的長官，說他跟江洋大盜串通，證據確鑿，不必審訊，可以當場殺掉。他這位結義兄弟還不知道怎麼回事兒呢，腦袋已經搬家了。
訊息傳到省城，把馬新貽樂得手舞足蹈。這次把心頭大患消滅了，心想現在可以高枕無憂了。誰知道他的結義兄弟竟然有好友，聽說了這件事，打抱不平，就到兩江總督的衙門附近轉悠，專門等著馬新貽出門，假裝是攔轎喊冤。然後三步並作兩步走，手拿利刃，一刀扎進了馬新貽的心口窩。身邊的差役急忙把兇犯抓獲，馬新貽已經不省人事了。抬回官衙看見他情婦模模糊糊地說了句「我害了你，你害了我」後，就兩眼一翻，雙腳一蹬，嗚呼哀哉了。他情婦一想，為了自己一個人，害死兩條人命，良心發現，也懸樑自盡。
後來審問刺客，他只是說「我是好漢張汶祥，刺死了馬新貽」，其他就沒有一句真話了。再後來經過曾國藩和鄭敦謹的複審，就像上面寫的那樣了。大俠幹些挺牛的事，一般都不到處宣揚，這才是他們的過人之處，從這件事就可見一斑。後來有人說張汶祥是革命人物，就跟徐錫麟刺殺恩銘一樣，這個恐怕就不是真的了。
同治帝即位後，忽忽悠悠，轉眼過了十年，同治帝已經十七歲了。就算是尋常的百姓人家，也應該讓他娶媳婦了，更何況是皇上呢！一幫滿蒙官員，只要家裡有女兒的，哪個不想把女兒嫁給皇上？一人得道，雞犬升天啊。
只是慈禧太后就生了這麼一個寶貝兒子，哪能不精挑細選，找個好點的兒媳婦？從同治八年起，就開始籌備大婚典禮，已經留意調查，直到十年冬天，這才挑選了幾個淑女加美女。一個是狀元郎、現任翰林院侍講崇綺的女兒阿魯特氏，一個是現任員外郎鳳秀的女兒富察氏，一個是舊任知府崇齡的女兒赫舍哩氏，一個是前任都統賽尚阿的女兒，也是阿魯特氏，才貌都差不多。
慈禧太后已經選好了，但還得跟慈安太后商量一下。慈安太后就說：「女的只要道德高尚就行，其他的都是次要的了。不知道這幾個哪個品德最好，可以當皇后？」
慈禧太后說：「我聽說這四個女孩兒，崇女年紀最大，今年已經十九歲，鳳女年紀最輕，今年才十四歲。」
慈安太后接話說：「皇后母儀天下，還是年紀大一點的好。」慈禧太后呆了呆，接著說：「鳳女雖然年輕，但據說她很賢淑。」
慈安太后就說：「立好皇后，還要選一些妃子，就讓她當妃子好了。」
慈禧太后說：「那就把恭親王奕訢找來，讓他也跟著商量一下吧！」
慈安太后點了點頭，接著讓太監把恭親王給找了來。不一會兒，恭親王過來進見，向兩位太后行了禮。慈禧太后就把立皇后的事說了，恭親王也主張立年紀大一點的。這事名正言順，慈禧太后也不好不答應。於是清政府就在第二年春天下達了一份命令：
奉慈安皇太后、慈禧皇太后的命令，皇帝從六歲繼承皇位，到現在已經十一年了。也應該選個賢惠的女人當老婆，立為皇后，以輔佐皇上在道德上的自我提升，並幫助管理宮裡的事情了。現在選了翰林院侍講的女兒阿魯特氏，端莊賢惠，特此立為皇后，已經命令占星師預測了好日子，就在本年九月舉行。所有一切採辦的事情和相關事宜，特派恭親王奕訢、戶部尚書寶鋆和各衙門共同辦理。
這份命令下達以後，恭親王等人揣摩慈禧太后的性格，知道她非常愛奢華，所以制定的禮儀也比平常多花費好幾倍。正在預備的時候，忽然由江蘇巡撫報告，兩江總督曾國藩出缺。恭親王吃了一驚，急忙進宮報告了兩宮太后。
兩宮太后也暗自嘆息，就命令同治帝停止三天辦公，並且下命令追贈曾國藩為太傅，按照大學士的待遇給予安葬，諡為文正，進入京城祭祀的昭忠祠、賢良祠。而且在湖南原籍、南京省城也都建立了專祠，把他一生的政績全部交給歷史工作者整理。一等侯爵讓他的兒子曾紀澤繼承，二兒子曾紀鴻被提拔為貢生，長孫曾廣鈞也被賞為舉人，還有曾廣鈞、曾廣銓等一幫子孫也都賞給員外郎、主事等職位。並派穆騰阿等人接連去祭拜。還有什麼御賜的祭文碑文等，也都是翰林院給寫的。實在太多，這裡提供兩篇：