九年正月，河南省請益兵，敕諸路籤軍三萬，詔元帥府、統軍司、總管萬戶府閱實軍籍。二月，命阿術典行省蒙古軍，劉整、阿里海牙典漢軍。四月，詔：「諸路軍戶驅丁，除至元六年前從良入民籍者當差。七年後，凡從良文書寫從便為民者，亦如之。餘雖從良，並令津助本戶軍役。」七月，閱大都、京兆等處探馬赤戶名籍。九月，詔樞密：「諸路正軍貼戶及同籍親戚僮奴，丁年堪役，依諸王權要以避役者，並還之軍，惟匠藝精巧者以名聞。」十二月，命府州司縣達魯花赤及治民長官，不妨本職，兼管諸軍奧魯。各路總管府達魯花赤、總管，別給宣命印信，府州司縣達魯花赤長官止給印信，任滿則別具解由，申樞密院。
十年正月，合剌請於渠江之北雲門山及嘉陵西岸虎頭山立二戍，以其圖來上，仍乞益兵二萬，敕給京兆新籤軍五千人益之。陝西京兆、延安、鳳翔三路諸色人戶，約六萬戶內，籤軍六千。五月，禁乾討虜人，其願充軍者，於萬戶、千戶內結成牌甲，與大軍一體徵進。八月，禁軍吏之長舉債，不得重取其息，以損軍力，違者罪之。九月，襄陽生券軍至都釋械繫免死，聽自立部伍，俾徵日本，仍於蒙古、漢人內選闢率領之。
十一年正月，初立軍官以功升散官格。五月，便宜總帥府言：「本路軍經今四十年間，或死或逃，無丁不能起補，見在軍少，乞選擇堪與不堪丁力，放罷貧乏無丁者，於民站內別選充役。」從之。詔延安府、沙井、淨州等處種田白達達戶，選其可充軍者，籤起出徵。六月，潁州屯田總管李珣言：「近為籤軍事，乞依徐、邳州屯田例，每三丁內，一丁防城，二丁納糧，可籤丁壯七百餘人，並元撥保甲丁壯，令珣通領，鎮守潁州，代見屯納合監戰軍馬別用。」從之。
十二年三月，遣官往遼東，籤揀蒙古達魯花赤、千戶、百戶等官子弟出軍。詔隨處所置襄陽生券軍之為農者，或自願充軍，具數以聞。五月，正陽萬戶劉復亨言：「新下江南三十餘城，俱守以兵，及江北、淮南、潤、揚等處未降，軍力分散，排程不給，以致鎮巢軍、滁州兩處復叛。乞籤河西等戶為軍，併力剿除，庶無後患。」有旨，命肅州達魯花赤，並遣使同往驗各色戶計物力富強者籤起之。六月，籤平陽、西京、延安等路達魯花赤弟男為軍。萊州酒稅官王貞等上言：「國家討平殘宋，吊伐為事，何嘗以賄利為心。彼不紹事業小人，貪圖貨利，作乾討虜名目，侵掠彼地，所得人口，悉皆貨賣，以充酒食之費，勝則無益朝廷，敗則實為辱國。其招討司所收乾討虜人，可悉罷之，第其高下，籍為正軍，命各萬戶管領徵進，一則得其實用，二則正王師吊伐之名，實為便益。」從之。
十四年正月，詔：「上都、隆興、西京、北京四路編民捕獵等戶，籤選丁壯軍二千人，防守上都。」中書省議：「從各路搭配，二十五戶內取軍一名，選善騎射者充，官給行資中統鈔一錠，仍自備鞍馬衣裝器仗，編立牌甲，差官部領，前來赴役。」十二月，樞密院臣言：「收附亡宋州城，新附請糧官軍，並通事馬軍人等，軍官不肯存恤，多逃散者，乞招誘之。」命左丞陳巖等，分揀堪當軍役者，收系充軍，依舊例月支錢糧。其生券不堪當軍者，官給牛具糧食，屯田種養。
十五年正月，定軍官承襲之制。凡軍官之有功者升其秩，元受之職，令他有功者居之，不得令子侄復代。陣亡者始得承襲，病死者降一等。總把、百戶老病死，不在承襲之例。凡將校臨陣中傷、還營病創者，亦令與陣亡之人一體承襲。禁長軍之官不恤士卒，及士卒亡命避役，侵擾初附百姓者，俱有罪。雲南行省言：「雲南舊屯駐蒙古軍甚少，遂取漸長成丁怯困都等軍，以備出征。雲南闊遠，多未降之地，必須用兵，已籤爨、僰人一萬為軍，續取新降落落、和泥等人，亦令充軍。然其人與中原不同，若赴別地出征，必致逃匿，宜令就各所居一方未降處用之。」九月，並軍士。初，至元九年籤軍三萬，止擇精銳年壯者，不復問其貲產，且無貼戶之助，歲久多貧乏不堪。樞密院臣奏，宜縱為民，遂併為一萬五千。諸軍戶投充諸侯王怯憐口、人匠，或託為別戶以避其役者，復令為軍，有良匠則別而出之。樞密臣又言：「至元八年，於各路軍之為富商大賈者一百四十三戶，各增一軍，號餘丁軍。今東平等路諸奧魯總管府言，往往人死產乏，不能充二軍，乞免餘丁充役者。」制可。十二月，樞密院官議：「諸軍官在軍籍者，除百戶、總把權準軍役，其元帥、招討、萬戶、總管、千戶或首領官，俱合再當正軍一名。」
十六年正月，罷五翼探馬赤重役軍。三月，括兩淮造回回砲新附軍匠六百人，及蒙古、回回、漢人、新附人能造砲者，至京師。五月，淮西道宣慰司官昂吉兒請招諭亡宋通事軍，俾屬之麾下。初，亡宋多招納北地蒙古人為通事軍，遇之甚厚，每戰皆列於前行，願效死力。及宋亡，無所歸。朝議欲編入版籍未暇也，人人疑懼，皆不自安。至是，昂吉兒請招集，列之行伍，以備征戍。從之。九月，詔河西地未籤軍之官，及富強戶有物力者，籤軍六百人。十月，壽州等處招討使李鐵哥，請召募有罪亡命之人充軍，其言：「使功不如使過。始南宋未平時，蒙古、諸色人等，因得罪皆亡命往依焉，今已平定，尚逃匿林藪。若釋其罪而用之，必能效力，無不一當十者矣。」十一月，罷太原、平陽、西京、延安路新籤軍還籍。
十七年七月，詔江淮諸路招集答剌罕軍。初平江南，募死士願從軍者，號答剌罕，屬之劉萬戶麾下。南北既混一，復散之，其人皆無所歸，率群聚剽掠。至是，命諸路招集之，令萬奴部領如故，聽範左丞、李拔都二人節制。
十八年二月，並貧乏軍人三萬戶為一萬五千，取帖戶津帖正軍充役。四月，置蒙古、漢人、新附軍總管。六月，樞密院議：「正軍貧乏無丁者，令富強丁多帖戶權充正軍應役，驗正軍物力，卻令津濟貼戶，其正軍仍為軍頭如故。或正軍實系單丁者，許傭僱練習之人應役，丁多者不得傭僱，軍官亦不得以親從人代之。」
十九年二月，諸侯王阿只吉遣使言：「探馬赤軍凡九處出征，各奧魯內復徵雜泛徭役，不便。」詔免之，並詔有司毋重役軍戶。六月，禁長軍之官，毋得佔役士卒。散定海答剌罕軍還各營，及歸戍城邑。十月，簽發漸丁軍士。遵舊制，家止一丁者不作數，凡二丁至五丁、六丁之家，止存一人，餘皆充軍。
二十年二月，命各處行樞密院造新附軍籍冊。六月，從丞相伯顏議，所括宋手號軍八萬三千六百人，立牌甲，設官以統之。十月，定出徵軍人亡命之罪，為首者斬，餘令減死一等。
二十一年八月，江東道僉事馬奉訓言：「劉萬奴乾討虜軍，私相糾合，結為徒黨，張弓挾矢，或詐稱使臣，莫若散之各翼萬戶、千戶、百戶、牌甲內管領為便。」省院官以聞，有旨，可令問此軍：「欲從脫歡出征虜掠耶？欲且放散還家耶？」回奏：「眾軍皆言，自圍襄樊渡江以來，與國效力，願令還家少息。」遂從之。籍亡宋手記軍。宋時有是軍，死則以兄弟若子承代。有旨，依漢軍例籍之，毋涅其手。
二十二年正月，立行樞密院於江南三省，其各處行省見管軍馬悉以付焉。九月，詔福建黃華畲軍，有恆產者放為民，無恆產與妻子者編為守城軍。徵交趾蒙古軍五百人、漢軍二千人，除留蒙古軍百人、漢軍四百人，為鎮南王脫歡宿衛，餘悉遣還，別以江淮行樞密院蒙古軍戍江西。十月，從月的迷失言，以乾討虜軍七百人，籍名數，立牌甲，命將官之無軍者領之。十一月，御史臺臣言：「昔宋以無室家壯士為鹽軍，內附之初，有五千人，除徵佔城運糧死亡者，今存一千一百二十二人。此徒皆性習兇暴，民患苦之，宜給以衣糧，使屯田自贍，庶絕其擾。」從之。十二月，從樞密院請，嚴立軍籍條例，選壯士及有力之家充軍。舊例，丁力強者充軍，弱者出錢，故有正軍、貼戶之籍。行之既久，而強者弱，弱者強，籍亦如故。其同戶異居者，私立年期，以相更代，故有老稚不免從軍，而強壯家居者，至是革焉。江浙省募鹽徒為軍，得四千七百六十六人，選軍官麾下無士卒者，相參統之，以備各處鎮守。
二十四年閏二月，樞密院臣言：「諸軍貼戶，有正軍已死者，有充工匠者，放為民者，有元系各投下戶回付者，似此歇閒一千三百四十戶，乞差人分揀貧富，定貼戶、正軍。」制可。
二十六年八月，樞密院議：「諸管軍官萬戶、千戶、百戶等，或治軍有法、鎮守無虞、鎧仗精完、差役均平、軍無逃竄者，許所司薦舉以聞，不次擢用。諸軍吏之長，非有上司之命，毋擅離職。諸長軍者，及蒙古、漢軍，毋得妄言邊事。」
成宗大德二年十二月，定各省提調軍馬官員。凡用隨從軍士，蒙古長官三十名，次官二十名，漢人一十名；萬戶、千戶、百戶人等，俱不得佔役。行省鎮撫止用聽探外，亦不得多餘役佔。
十一年四月，詔禮店軍還屬土番宣慰司。初，西川也速迭兒、按住奴、帖木兒等所統探馬赤軍，自壬子年屬籍禮店，隸王相府，后王相府罷，屬之陝西省，桑哥奏屬土番宣慰司，鹹以為不便，大德十年命依壬子之籍，至是復改屬焉。
武宗至大元年正月，以通惠河千戶劉粲所領運糧軍九百二十人，屬萬戶赤因帖木爾兵籍。十二月，丞相三寶奴等言：「國制，行省佐貳及宣慰使不得提調軍馬，若遙授平章、揚州宣慰使阿憐帖木兒者，嘗與成宗同乳母，故得行之，非常憲也。今命沙的代之，宜遵國制，勿令提調。」制可。
仁宗皇慶元年三月，中書省臣奏李馬哥等四百戶為民。初，李馬哥等四百戶屬諸侯王脫脫，乙未年定籍為民，高麗林衍及乃顏叛，皆嘗籤為軍。至元八年置軍籍，以李馬哥等非七十二萬戶內軍數，復改為民。至大四年，樞密院復奏為軍。至是，省闢以為言，命遵乙未年已定之籍。後樞密復奏，竟以為軍戶。十二月，省臣言：「先是樞密院奏準，雲南省宜遵各省制，其省闢居長者二員，得佩虎符，提調軍馬，餘佐貳者不得預，已受虎符者悉收之。今雲南省言，本省籍軍士之力，以辦集錢穀，遇有調遣，則省闢親率眾上馬，故舊制雖牧民官亦得佩虎符，領軍務，視他省為不同。臣等議，已受虎符者依故事，未受者宜頒賜之。」制可。
二年正月，詔：「雲南省鎮遠方，掌邊務，凡事涉軍旅者，自平章至僚佐須同署押，其長官二員，復與哈必赤。」
延祐元年二月，四川省軍官闕員，詔：「依民官遷調之制，差人與本省提調官及監察御史同銓注。」
三年三月，命伯顏都萬戶府及紅胖襖總帥府各調軍九千五百人，往諸侯王所，更代守邊士卒。其屬都萬戶府者，軍一名，馬三匹；屬總帥府者，軍一名，馬二匹。令人自為計，其貧不能自備者，則命行伍之長及百戶、千戶等助之。悉遣精銳練習騎射之士。每軍一百名，百戶一員；五百名，千戶一員。覆命買住、囊加二人分左右部領之。