在北原蒼介的幫助下，化名為「灰原茜」的宮野明美和灰原哀獲得了一整套的身份資料——戶籍、社會保險、醫療保險、就診記錄、學籍資料等等。
「灰原姐妹」父母雙亡（悠樹找到了一對在七年前去世的、姓「灰原」的夫婦的資料），兩人被親戚帶到國外生活多年，因為妹妹灰原哀無法適應國外的學校環境，遂在幾個月前返回日本。
在國外生活的軌跡、納稅和就醫的記錄、出入境的記錄等等，悠樹將擁有類似經歷的人的資料修修改改融合拼接，形成一份無論任誰看來都毫無破綻的資料。他甚至在資料中「灰原姐妹」生活過的城市找了幾個網上論壇，暗戳戳插入了一些聊天記錄和照片，好像那裡確實生活過這麼兩個人一樣。
有這些資料在，哪怕今後真的有人對她們的身份產生懷疑，那麼接下來的調查也會打消一切疑慮，越有能量的人，反而越看不穿其中的破綻。
當然，同樣極為真實的資料，悠樹也給自己弄了一份。
新的身體前兩天才剛剛做好，於是之前因為「得了重感冒而在醫院治療」的北原悠樹終於康復，回到了小夥伴當中。
灰原哀選擇維持現在的身份，「江戶川柯南」卻迫不及待地想要恢復成原來的自己。有了完整的資料和全套裝置，灰原哀很快研製出真正的解藥。隨後「江戶川文代」從美國返回，她邀請毛利一家和北原蒼介等人、柯南邀請少年偵探團的孩子們，眾人一起在高階餐廳吃了一頓大餐，順便還解決了一起案件，最後在回家的路上柯南決定跟小夥伴們道別。
「抱歉，大家。」
當孩子們走了一段路發現柯南落在了最後面，回過頭來喊他的時候，卻聽到男孩帶著不捨和懷念，笑了笑，用格外溫柔鎮定的聲音說道：「我要離開了。」
「離開？」元太不明白：「你要去哪兒？啊，我知道了！你又要偷跑是不是？」
男孩瞪圓了眼睛，氣呼呼地說。
然而這一次，柯南不像以前一樣含糊其次，也不是因為太危險而呵斥他們待在原地。黑髮男孩用留戀的目光依次看過這些熟悉的小夥伴們，某種凝重而感傷的氣氛讓所有人都安靜下來，孩子們不安地看著他。
周圍的成年人都知道真相，卻選擇了不去打擾，反而體貼地走遠了一些，將一切交給孩子們自己來解決。
柯南看了一眼不遠處的毛利蘭，深吸一口氣，對孩子們說：「我爸爸媽媽要帶我去國外生活了，以後我就在那邊的學校上學，轉學的手續也已經辦好了……所以……」
看著孩子們的眼睛，他有點說不下去了。
「真的嗎，柯南君？」光彥一臉的難以置信。
「騙人！」元太握著拳頭大叫道：「我們不是少年偵探團嗎？你難道要當逃兵嗎？」
「我不相信……柯南君要是去了國外的話，以後不就見不到了嗎？」步美放聲大哭道：「我不要這樣！不要離開好不好，柯南君？」
悠樹倒是還算從容，他一開始就知道柯南的身份，在他看來，不管柯南外表變成什麼樣，都是自己的朋友。就是以後去上學的時候少了一個人，多少會有些不適應。
灰原哀站在孩子們旁邊，微微低著頭，一言不發。垂落的髮絲在她的眼睛上留下了一片陰影，讓人看不清她眼中的情緒。
她知道「柯南」不會真正離開，但等他回來的時候，就是高中生偵探工藤新一，而不再是整天和他們一起上學、一起玩耍、一起露營、一起冒險的「江戶川柯南」。
好難過啊，就像是心被生生地撕下了一塊似的。
然而眼看孩子們的眼淚和喊叫讓柯南手足無措，灰原哀提起聲音道：「好啦，別這麼任性！」
眾人的聲音頓時一止。
灰原哀和柯南一直是少年偵探團的領頭羊，而且女孩聰明穩重、思想成熟又充滿神秘感，平時性格也較為冷淡，幾個小孩多多少少對她都有些敬畏的心理，平時灰原哀的話比柯南的更管用。
此時灰原哀嚴肅地看著孩子們，像以前一樣冷靜地說道：「步美，元太，光彥，你們回家的時候，都可以跟自己的爸爸媽媽待在一起，對吧？」
三個孩子乖乖點頭。
「那你們能想象離開父母幾個月、甚至幾年的感覺嗎？」
孩子們：「……」
搖頭。
別說幾個月，哪怕只是兩三天看不見，都會特別想念。
「江戶川君也一樣，他也會想和自己的父母生活在一起，而不是單獨一個人留在日本。」灰原哀垂下眼睛，道：「他能跟家人團聚，是值得慶祝的事。作為朋友，我們應該……為他高興，而不是去勉強他留下來。」
孩子們忍不住回頭去看「江戶川文代」。
胖胖的女人拎著手提包站在不遠處的商鋪屋簷下，伸著脖子看著他們這邊，顯然十分關心，卻忍耐著沒有過來打擾他們的告別。
柯南的爸爸媽媽肯定也很愛他吧？很想念吧？他們一家人分開了這麼久，柯南不知道有多盼著能回到自己父母身邊吧？
他們這樣哭著喊著要求柯南留下來，完全不去考慮柯南和他父母的心情，真是……太差勁了！
伴隨著這種想法，孩子們都真正地安靜下來，但眼淚卻沒有聽話的平息下來，反而變得更加洶湧。