隨著諒江城的失守，黎利率軍緊急抽掉了一部分圍困安梁縣城的叛軍回交州府待命，以防明軍的突襲。
當明軍水師的船隻出現在新安府等地的訊息傳到小河鎮時，黎利立刻召集了叛軍將領開了一次高階會議，最終決定固守交州城全力應戰抵達的驍武軍。
因此，在會議結束的第二天，圍困安梁縣城兩三個月的叛軍開始拔寨啟程，退回了交州府地界的立濂城，在立濂城屯兵三萬防備三江府的明軍。
等確定了叛軍撤退，安梁縣城的明軍軍民頓時歡呼雀躍，他們原本以為要在安梁縣城經歷一場血戰，誰也沒有想到叛軍竟然會撤退。
後來他們才聽說了驍武軍已經乘坐大明水師的船隻來交趾的事情，立刻群情振奮，士氣高漲，以前失利的陰霾一掃而空。
自此，明軍與叛軍在交趾的對峙態勢正式成形，按照與李雲天的約定，黎利逐漸撤回了那些在明軍控制地盤內的叛軍，雙方的界線逐漸清晰起來。
李雲天也遵守了協議，而且在三江城和諒江城的駐軍都只有約定的一半，即各五千人，以示自己無意進攻叛軍，讓黎利放心。
其餘的明軍被李雲天撤到了太原府和新安府進行整編，他對交趾的駐軍進行了大刀闊斧的革新，不僅淘汰了軍隊上的老弱病殘，而且還對交趾軍戶進行了一項重大改革，那就是允許交趾軍戶不用參軍，而已從事講武堂下屬產業的經營作為代替。
換句話來說，李雲天實際上已經廢除了交趾的軍戶，只不過沒有明說而已。
他這樣做有著充足的道理，畢竟交趾不同於大明的兩京十三省，其人口以交趾當地土人百姓居多，因此大明要想真正將其治理好並不能單單依靠武力，當務之急是通過那些從內陸遷移而來的居民來發展交趾的農業和經濟，以此來開啟局面。
因為交州城已經被叛軍佔領，故而李雲天下令交趾布政使司、按察使司和都司等衙門前往太原府太原城公辦，以太原城為交趾的臨時治所。
宣德三年二月底，歷經十餘年叛亂的交趾終於平靜了下來，明軍和叛軍紛紛進入了休整期，像兩頭激烈廝殺後疲憊的野獸各自著身上的傷口。
與此同時，明軍和叛軍都將事務的重點轉移到了農業和經濟的建設上來，連年的戰火已經使得不少百姓食不果腹，雙方都要抓緊時間來解決糧食問題。
雖然黎利與李雲天私下裡達成了協議，但他並沒有掉以輕心，暗中積蓄著力量，不僅像李雲天一樣開始整軍，而且還與橫行在南洋水域的海盜取得了聯絡，通過那些海盜與南洋諸國進行海上貿易來獲取利潤，用來支撐叛軍的各項開銷。
黎利這樣做是逼不得已，由於他正在與大明打仗，故而周邊的占城、真臘等國都不會與其交易，他也只能將目光投向海外。
李雲天並沒有理會黎利的海上貿易，在他看來黎利這樣做只是解了燃眉之急而已，並不能真正解決叛軍的財政壓力，除了叛軍的軍需外，叛軍轄地內百姓的安置和救濟都需要錢財，這將使得黎利為此頭疼不已。
這個時候，大明作為天朝上國的優勢就彰顯了出來，李雲天不僅從廣西的官倉調來了大批救濟給轄地內的百姓，而且還免除了轄地內百姓兩年的賦稅徭役。
當免除兩年賦稅徭役的訊息一齣，明軍控制州府內的百姓頓時一派歡騰，這意味著他們兩年之內沒有了田賦和丁稅，可以安心從事各自的事務，所有的收入和守城都將歸個人所有。
由於沒有了田賦和丁稅，交趾三司和各地方衙門的開銷將由李雲天籌集的平叛大軍軍費來支付。
為了彌補免除田賦和丁稅後的交趾地方衙門的財政壓力，李雲天以定南將軍的名義正式下發了《交趾商事法》，既規定了在交趾境內的商貿活動受講武堂交趾商務司保護，同時也明確規定了新的商業稅率，包括茶、鹽、布料和礦石等商品的稅率。
新稅率與李雲天在揚州競拍交趾商業專營權和採礦權時制定的一樣，遠高於大明兩京十三省的稅率。
其中，尤為引人注意的是李雲天在交趾成立的一個新衙門――講武堂交趾商務司。
講武堂交趾商務司不僅統掌了交趾境內的商業事務，而且還接管了雲屯市舶司，將原本由交趾布政司管轄的雲屯市舶司納入到了講武堂交趾商務司的麾下，權力之重可見一斑。