空軍學院，直屬空軍司令部，主要承擔飛行員培養任務，下轄5個航空隊，分為戰鬥、攻擊、轟炸、偵察與運輸，一般要求飛行員掌握兩個科目，考慮到科目屬性，大多數情況下都是戰鬥/偵察，攻擊/偵察，轟炸/運輸三類。海軍航空兵同樣在空軍學院受訓，但在空軍學院畢業後，還需要到葫蘆島基地接受1年左右的上艦訓練，而一般飛行學院分配到聯隊後只要半年就可以正式入編，因此海軍航空兵的選拔標準更為苛刻一些。從軍銜上也可以看出來，陸軍飛行員起步軍銜是少尉，而海軍飛行員起步軍銜是中尉。按照小隊、中隊、大隊、聯隊的編制，上尉擔任小隊長，少校擔任中隊長，上校擔任大隊長，聯隊長就是准將了
院長：秦國鏞中將
副院長：餘焜和少將
教育總監：李寶浚少將
技術總監：譚根少將
第一航空研究所，重點研究戰鬥機、攻擊機、偵察機等，駐地南苑
所長：馮如中將
副所長：巴玉藻上校
工程處處長：曾貽經中校
第二航空研究所，重點研究轟炸機、運輸機、水上飛機等，駐地秦皇島
所長：譚根少將
副所長：王助中校
工程處處長：王孝豐少校
同時，飛行器製造正式從遼陽體系中剝離出來，成立了中國航空工業製造總公司，駐地包頭，臨近中國裝甲工業製造總公司，承擔全部定型飛機的製造工作。事實上，在早期的航空器研製中，航空發動機與裝甲發動機在很多時候是可以通用的。
何峰最後說道：「這個編制其他都不令人擔心，唯一有點麻煩的是如何處理海軍航空兵與陸軍航空兵之間的關係。從飛機的生產、製造、訓練、使用來看，海陸具有高度的通用性，從作戰來看，海軍航空兵應該直屬於海軍管理更為方便。更麻煩的是，空軍脫離總裝管轄後，軍費獨立，就海軍航空兵這個領域如何切割與海軍的關係，也是一個難題。」
這個話一齣口，薩鎮冰就急了：「大總統、陸總長、何主任，我們海軍認為，海軍航空兵最好仿效海軍陸戰隊的管理辦法，由海軍進行統一管理，形成海軍三位一體的打擊力量，至於軍費什麼的，當然好商量。不僅空軍學院培養飛行員海軍會掏錢，航空研究所、國航公司的研發製造海軍同樣承擔費用。我們唯一的要求便是，海軍飛行員的要求更高一些，希望畢業時能由海軍先挑。」
秦時竹大笑：「薩老的算盤好精啊，其他我原則上都同意了，唯獨這最後一條先挑的要求太過於掐尖了，恐怕空軍會找你拼命的。還得琢磨一個兩全其美的辦法，各位提提意見。」