董卓無意中得到了一張王牌，他擁簇著少帝，帶著軍隊浩浩蕩蕩地開進洛陽城。
在何進決定調董卓領兵入京時，主簿陳琳曾經提醒他說：「大兵一到，強者稱雄，這樣做是倒拿干戈，授柄於人，不但不能達到目的，恐怕還會引起混亂呢！」
目睹董卓八面威風，不可一世的模樣，剛剛從泰山募兵回到洛陽的鮑信憂慮地對袁紹說：「董卓擁有強兵，居心叵測，如果不能及早採取措施，就要陷入被動，如果乘他長途行軍，士馬勞頓，發起突然襲擊，還能擒拿他。」袁紹見董卓兵強馬壯，心裡害怕，不敢輕舉妄動。
鮑信不覺非常失望，帶兵回泰山去了。董卓十分驕橫，決意實行廢立，以建立個人的權威。
他傲慢地對袁紹說：「天下之主，應該選擇賢明的人。劉協似乎還可以，我想立他為帝。如果還不行，劉氏的後裔也就沒有留下的必要了。」
袁紹一聽非常生氣，針鋒相對地說：「天底下強大的人，難道只有董公你麼！」說完橫握佩刀，向董卓拱了拱手，揚長而去。
袁紹不敢久留洛陽，他把朝廷所頒符節掛在上東門上，逃亡冀州。董卓下令通緝袁紹，當時有人勸董卓說：「廢立大事，不是一般人能理解的。
袁紹不識大體，因此害怕逃跑，並非有其它意思。如果通緝他太急，勢必激起事變。
袁氏四代廣佈恩德，門生、故吏遍佈天下。如果袁紹招集豪傑，拉起隊伍，群雄都會乘勢而起，那時，關東恐怕就不是明公所能控制得了，所以不如赦免他，給他一個郡守噹噹，那麼，他慶幸免罪，也就不會招惹事端了。」於是，董卓任命袁紹為勃海太守，賜爵位為邟鄉侯。
西元189年（中平六年）九月，董卓廢少帝為弘農王，立劉協為帝，是為獻帝，他自署相國，又自稱「貴無上」，性極殘忍。是時，「洛中貴戚室第相望，金帛財產，家家殷積。卓縱放兵士，突其廬舍，淫略婦女，剽虜資物，謂之‘搜牢’」。
董卓擅行廢立和種種暴行，引起了官僚士大夫的憤恨，他所任命的關東牧守也都反對他。
各地討伐董卓的呼聲日益高漲。而討伐董卓，袁紹是最有號召力的人物，這不僅因為他的家世地位，還因為他有誅滅宦官之功和不與董卓合作的舉動。
本來，冀州牧韓馥恐怕袁紹起兵，故派遣幾個部郡從事駐勃海郡監視，限制袁紹的行動。
這時，東郡太守橋瑁冒充三公寫信給各州郡，歷數董卓罪狀，稱「受董卓逼迫，無以自救，亟盼義兵，拯救國家危難」云云。韓馥接到信件，召集部屬商議，他問大家：「如今應當助袁氏呢，還是助董氏呢？」
治中從事劉子惠正色說：「興兵是為國家，如何說什麼袁氏、董氏！」韓馥語塞，臉有愧色。迫於形勢，韓馥不敢再阻攔袁紹，他寫信給袁紹，表示支援他起兵討董。
西元190年（初平元年）正月，關東州郡起兵討董，推舉袁紹為盟主。袁紹自號車騎將軍，與河內太守王匡屯河內，韓馥留鄴，供給軍糧。
豫州刺史孔伷屯潁川，兗州刺史劉岱、陳留太守張邈、廣陵太守張超、東郡太守橋瑁、山陽太守袁遺、濟北相鮑信與曹操屯酸棗，後將軍袁術屯魯陽，各有軍隊數萬。
董卓得知袁紹在山東起兵，就把袁紹的叔父袁隗以及在京師的袁氏宗族全部給殺了。
董卓接著派大鴻臚韓融、少府陰循、執金吾胡母班、將作大匠吳循、越騎校尉王瓖來曉諭勸解袁紹等各路軍隊。
袁紹指派王匡殺掉了胡母班、王瓖、吳循等人，袁術也捕殺了陰循，只有韓融因為德高望重免於一死。
此時，豪傑大多歸附袁紹，而且因他一家遭難受感動，人人想著為他報仇，所以州郡蜂擁而起的部隊，沒有不打袁氏旗號的。