《述異記·捲上》雲：「太原村落間祭蚩尤神，不用牛頭」。又云「漢武時，太原有蚩尤神晝見……其俗遂為立祠」。又載：「今冀州有樂名蚩尤戲，其民兩兩三三，頭載牛角而相[]。漢造角[]戲，蓋其遺制也」。秦漢置太原郡，屬幷州，首縣晉陽，治在今山西太原市。兩漢時的冀州，地在今河北南部、山西南部及河南省黃河以北地區。
依上列籍記述，關於蚩尤的遺蹟、遺俗、傳說，歷數千年之久，逮至秦漢，仍然以濃烈的色彩儲存於民間。在北至河北涿鹿，西至山西太原運城，東到山東東平，南至江蘇沛縣的廣大地區，禮祠蚩尤之俗經久不衰。按「民不祀非族」的古俗，這些地區定有為數眾多的蚩尤遺裔，才能具備形成和保持這種祭祀蚩尤民俗的社會條件。這些地區在兩漢時期又是漢族政治經濟文化的腹心之地，無疑有相當多的蚩尤遺裔成為漢族成員。
蚩尤遺裔見於載籍者，有鄒氏屠氏。王嘉《拾遺記》載：「軒轅去蚩尤之兇，遷其民善者於鄒屠之地，遷惡者於有北之鄉。其先以地命族，後分為鄒氏屠氏」。鄒姓屠姓今為漢族常姓。
「有北之鄉」指北方寒冷不毛之地，見於《詩·小雅·巷伯》，也穎達疏：「北方太陰之氣寒涼而無土毛，不生草木，寒凍不可居處」。說明曾經有一部份蚩尤遺裔被遷到北方。蒙古族學者陶克濤著《氈鄉春秋——匈奴篇》，論蚩尤是匈奴在傳說時代的稱號，被黃帝北逐的葷粥當是蚩尤[11]（部落遺裔）。司馬貞《史記索隱》釋葷粥：「匈奴之別名也，唐虞以上曰山戎，亦曰燻粥，夏曰淳維，殷曰鬼方，周曰[儼]狁，漢曰匈奴」，《周書·帝紀第一》：「太祖文皇帝守文氏，諱泰，字黑獺，代武川人也。其先出自炎帝神農氏，為黃帝所滅，子孫遁居朔野」。《新唐書·宰相世系表》指出：「宇文氏出自匈奴南單于之裔」。
古有仇猶國，西元前457年被晉國智伯所滅。《史記·樗裡子傳》記：「智伯之伐仇猶，遺之廣車，因隨之以兵，仇猶遂亡」。今山西盂縣東北有仇猶國遺址。仇猶與蚩尤音近，其國或為蚩尤遺裔所建。
蚩尤部落遺裔之向南遷者，不見經傳，但存口碑。黔東南苗族史詩《楓木歌》，說苗族始祖姜央（炎）是從楓樹樹心中生出來的。苗族學者聯絡《山海經·大荒南經》記：「有宋山者，有木生山上，名曰楓木。楓木，蚩尤所棄其桎梏，是謂楓木」。論證苗族為蚩尤之裔[12]。《苗族簡史》載：「川南、黔西北一帶有蚩尤廟，受到苗族人民的供奉」。從楓木中生出苗族始祖之傳說，實涵蚩尤再世之象徵意義。
《尚書·周書·呂刑》將蚩尤與苗民相提並論：「蚩尤惟始作亂，延及平民。罔不寇賊鴟義，奸宄奪攘矯虔。苗民弗用靈，制以刑」。說「作亂」是從蚩尤開始的，延及平民，無不以各種方式取人財物：群行攻劫曰寇，殺人曰賊，以鴟張跋扈為義；作亂在外曰奸，作亂在內曰宄，強取曰奪，竊取曰攘，詐取曰矯，固取為虔。「靈」意為善，即不以善教化，而是製作刑法。指斥苗民沿襲了蚩尤之習性。時至今日，布依族仍稱苗族為「布由」。布依族「布」意為「人」或「族」。在祠法上是限制成分在中心成分之後，「布由」意為「由族」亦可記為「尤族」。與蚩尤部落的他稱一致。
《帝王世紀》載炎帝神農氏崩葬長沙茶鄉。茶鄉即今湖南茶陵縣，在湘贛邊界羅霄山脈西側。古三苗居地亦曾及於湘贛間。據《史記·吳起列傳》記：「昔三苗之居，左洞庭，右彭蠡」。洞庭即今日洞庭湖，彭蠡即今鄱陽湖。因此，三苗極可能是從神農氏之裔，或即蚩尤（農部落）之遺裔發展而來的遊耕農部落群。苗族普遍存在長時間遠距離遷徙的傳說歷史。這是與其較長時間地保持遊耕農業經濟的生產方式分不開的。當然，也有政治和社會的原因。
還應當注意到，如同漢族是多元形成的一樣，作為中國南方的一個古老的族群，苗族原初的族源即呈現出多元性。苗族古稱「苗民」或「三苗」。除了上述炎帝神農氏和蚩尤（農部落）與「苗民」、「三苗」有直接的族源關係而外，黃帝之裔縉雲氏、顓頊之裔驩頭也都分別是三苗、苗民的主要族源之一。在榕江一偏僻苗塞中發掘出的「苗族古歌」，解答了榕江西山上「苗王廟」的千古之謎，同時解釋並確認了「苗王廟」所供的祖像是中華民族三大始祖之一「蚩尤」。
「三苗」之始見載籍，有《尚書·虞書》：「竄三苗於三危」。孔穎達疏：「三苗，國名，縉雲氏之後」。此所謂「國名」，實為部落名稱。「縉雲氏」是黃帝部落中的一個氏族名稱，後發展為部落名稱。《史記正義》案：「黃帝有熊國君，號曰有熊氏，又曰縉雲氏，又曰帝鴻氏，亦曰帝軒氏」。直接指縉雲氏為黃帝。《史記集解》說黃帝「亦號軒轅氏」。杜預注《左傳·文十八年》：「縉雲，黃帝時官名」。此所謂「官名」，實指黃帝部落的分職名稱。《左傳·昭十七年》記：「昔者黃帝氏以雲紀，故為雲師而名」。即以雲作為本部落以氏族為單位的軍事編制（雲師）的名稱和該氏族所擔任的部落公職名稱（雲名）。
《史記集解》引應劭曰：「黃帝受命，有云瑞，故以雲紀事也。春官為表雲，夏官為縉雲，秋官為白雲，冬官為黑雲，中官為黃雲」。列出春夏秋冬的官名，如《周禮》，春官宗伯管祭祀禮樂，夏官司馬管行政軍事，秋官司寇管刑法禁令，冬官司空管工程建設。這種以云為公職名稱是早期黃帝部落內部由各氏族分別擔任的部落公職，至於黃帝成為部落聯盟首領之後，由各部落分別擔任的部落聯盟公職名稱，如《管子·五行》所記，則稱為「當時」（天官）、「稟者」（地官）、「土師」（春官）、「司徒」（夏官）、「司馬」（秋官）、「李」（冬官）。今浙江省有縉雲縣，其縣有縉雲山，相傳為黃帝遊仙之處。
《廣韻》釋「竄」為「放也」，即流放之意。「三危」，孔安國傳曰：「西裔之山」，裔指邊遠之地。《山海經·西山經》有「三危之山」，郭璞注：「今在敦煌郡」。漢置敦煌郡，治在今甘肅敦煌市。敦煌市東北有三危山，今置三危鎮。《史記·五帝本紀》載：「三苗在江淮、荊州數為亂。於是舜歸而言於帝，請……遷三苗於三危，以變西戎」。「戎」本意指山間谷地，用以指人群，意即居於山間谷地之人，今之所謂「山地民」是也。「西戎」即西方山地民。今日黔西北苗族流傳的古史傳說，言其祖先原住積石山以西，從日沒方向移到積石山，經過若干代的長途遷徙，渡過黃河，到了長江中游一帶，最後進入西南地區。[13]
《山海經·大荒北經》記：「西北海外，黑水之北，有人有翼，名曰苗民（敦璞注：三苗之民）顓頊生驩頭，驩頭生苗民。」驩頭又作驩兜，見《尚書·舜典》：「放驩兜於崇山」。又作驩兜，見《史記·五帝本紀》：「放驩兜於崇山，以變南蠻」。崇山在今湖南大庸市西南，此地屬武陵山區，行政建置屬湘西土家族苗族自治州。《苗族簡史》說，湘西苗族五大姓之一的石姓，與驩兜有親緣關係。石姓有大小之分，大石姓在苗語中被稱為「驩兜」，[14]瀘溪、花垣有驩兜墓、驩廟。
綜合漢文古籍記載，蚩尤是中國原始社會末期活躍在今河北山西及山東西部的一個農耕部落名稱，即該農耕部落酋長與部落民之共同名稱。蚩尤部落為神農氏氏族後裔，屬炎帝部落聯盟。傳說蚩尤部落善長於金屬冶煉和製造兵器。蚩尤部落與黃帝部落爭戰失敗，其遺裔大部份留居中原。據《管子》所記，蚩尤部落加入了黃帝為首的部落聯盟，並在其中擔任了重要公職。《拾遺記》載，鄒氏、屠氏為其遺裔中可查之姓氏。
蚩尤部落中一部份遷到北方，與葷粥（匈奴之別名）有族源關係。
蚩尤部落中的南遷者，與苗民、三苗有族源關係。三苗來源呈多元性，除蚩尤遺裔之名，尚有黃帝縉雲氏之後，顓頊氏之後等。
從關於蚩尤和三苗傳說的記述中，可以看到中華大地上，原始社會末期部落間由匯聚、爭戰、融合、遷徙待環節所構成的大規模的攪拌運動。這種攪拌運動造成了中華各族在起源形成階段就已經是你中有我，我中有你，密不可分的狀況。
黃帝戰蚩尤
數千年前，中國黃河、長江流域一帶住著許多氏族和部落。其中黃帝是黃河流域最有名的一個部落首領。另一個有名的部落首領叫炎帝。黃帝和炎帝是兄弟。在長江流域有一個九黎族，他們的首領名叫蚩尤，十分強悍。
蚩尤有八十一個兄弟，他們個個獸身人面，銅頭鐵臂猛無比。他們擅長製造刀、弓弩等各種各樣的兵器。蚩尤常常帶領他強大的部落，侵略騷擾別的部落。有一次，蚩尤侵佔了炎帝的地方，炎帝起兵抵抗，但他不是蚩尤的對手，被蚩尤殺得一敗塗地。炎帝沒辦法，逃到黃帝所在的地方涿鹿請求幫助。黃帝早就想除去這個部落的禍害，於是聯合各部落首領，在涿鹿的田野上和蚩尤展開一場大決戰，這就是著名的「涿鹿大戰」。
戰爭之初，蚩尤憑藉著良好的武器和勇猛計程車兵，連連取勝。後來，黃帝請來龍和其它奇怪的猛獸助戰。蚩尤的兵士雖然兇猛，但是遇到黃帝的軍隊，加上這一群猛獸，也抵擋不住，紛紛敗逃。
黃帝帶領兵士乘勝追殺，忽然天昏地黑，濃霧迷漫，狂風大作，雷電交加，天上下起暴雨，黃帝的兵士無法繼續追趕。原來蚩尤請來了「風神」和「雨神」來助戰。黃帝也不甘示弱，請來天上的「旱神」幫忙，驅散了風雨。一剎那之間，風止雨停，晴空萬里。
蚩尤又用妖術製造了一場大霧，使黃帝的兵士迷失了方向。黃帝利用天上北斗星永遠指向北方的現象，造了一輛「指南車」，指引兵士衝出迷霧。
經過許多次激烈的戰鬥，黃帝先後殺死了蚩尤的八十一個兄弟，並最終活捉了蚩尤。黃帝命令給蚩尤帶上枷鎖，然後處死他。因為害怕蚩尤死後作怪，將他的頭和身子分別葬在相距遙遠的兩個地方。蚩尤戴過的枷鎖被扔在荒山上，化成了一片楓林，每一片血紅的楓葉，都是蚩尤的斑斑血跡。
蚩尤死後，他勇猛的形象仍然讓人畏懼，黃帝把他的形象畫在軍旗上，用來鼓勵自己的軍隊勇敢作戰，也用來恐嚇敢於和他作對的部落。後來，黃帝受到了許多部落的支援，漸漸成為所有部落的首領。
黃帝多才多藝，有許多發明創造，像造宮殿、造車、造船、製作五色衣裳等等。黃帝的妻子嫘祖，也是一位發明家。本來，蠶只有野生的，人們還不知道蠶的用處，是嫘祖教人們養蠶、繅絲、織帛，從此，中國開始有了絲綢文明。黃帝發明了亭子後，她還發明瞭雨天能移動的亭子——雨傘。
中國古代的傳說都十分推崇黃帝，後代的人都認為黃帝是華夏族的始祖，自己是黃帝的子孫。因為炎帝族和黃帝族原來是近親，後來又融合在一起，所以中國人也常常把自己稱為炎黃子孫。為了紀念這位傳說中的共同祖先，中國人還在黃河邊上的陝西省黃陵縣北面的橋山上建造了一座「黃帝陵」。每年春天，世界各地的華人代表都聚集到這裡，共同朝拜這位中華民族的始祖。
黃帝戰蚩尤另外一個版本
黃帝打敗炎帝之後，許多諸侯都想擁戴他當天子。可是炎帝的子孫不甘心向黃帝臣服，幾次三番挑起戰爭，尤以蚩尤為甚。
蚩尤是炎帝的孫子。據說，蚩尤生性殘暴好戰，他有八十一個兄弟，都是能說人話的野獸，一個個銅頭鐵額，用石頭鐵塊當飯吃。蚩尤原來臣屬於黃帝，可是炎帝戰敗後，蚩尤在廬山腳下發現了銅礦，他們把這些銅製成了劍、矛、戟、盾等兵器，軍威大振，便起野心要為炎帝報仇了。蚩尤聯合了風伯、雨師和夸父部族的人，氣勢洶洶地來向黃帝挑戰。
黃帝生性愛民，不想戰伐，一直想勸蚩尤休戰。可是蚩尤不聽勸告，屢犯邊界。黃帝不得已，嘆息道：「我若失去了天下，蚩尤掌管了天下，我的臣民就要受苦了。我若姑息蚩尤，那就是養虎為患了。現在他不行仁義，一味侵犯，我只有懲罰不義！」於是黃帝親自帶兵出征，與蚩尤對陣。
黃帝先派大將應龍出戰。應龍能飛，能從口中噴水，它一上陣，就飛上天空，居高臨下地向蚩尤陣中噴水。剎那間，大水洶湧，波濤直向蚩尤衝去。蚩尤忙命風伯雨師上陣。風伯和雨師，一個颳起滿天狂風，一個把應龍噴的水收集起來，反過來兩人又施出神威，颳風下雨，把向黃帝陣中打去。應龍只會噴水，不會收水，結果，黃帝大敗而歸。
不久，黃帝重整軍隊，重振軍威，再次與蚩尤對陣。黃帝一馬當先，領兵衝入蚩尤陣中。蚩尤這次施展法術，噴煙吐霧，把黃帝和他的軍隊團團罩住。黃帝的軍隊辨不清方向，看不清敵人，被圍困在煙霧中，殺不出重圍。就在這危急關頭，黃帝靈機一動，猛然抬頭看到了天上的北斗星，斗柄轉動而鬥頭始終不動，他便根據這個原理髮明瞭指南車，認定了一個方向，黃帝這才帶領軍隊衝出了重圍。
這樣，黃帝和蚩尤一來二去打了七十一仗，結果是黃帝勝少敗多，黃帝心中非常焦慮不安。這一天，黃帝苦苦思索打敗蚩尤的方法，不知不覺昏然睡去，夢見九天玄女交給他一部兵書，說：「帶回去把兵符熟記在心，戰必克敵！」，說罷，飄然而去。黃帝醒後，發現手中果真有一本《陽符經》。開啟一看，只見上面畫著幾個象形文字「天一在前，太乙在後。」黃帝頓然悟解，於是按照玄女兵法設九陣，置八門，陣內佈置三奇六儀，制陰陽二遁，演習變化，成為一千八百陣，名叫「天一遁甲」陣。黃帝演練熟悉，重新率兵與蚩尤決戰。
為了振奮軍威，黃帝決定用軍鼓來鼓舞士氣。他打聽到東海中有一座流波山，山上住著一頭慢獸，叫「夔」，它吼叫的聲音就像打雷一樣。黃帝派人把夔捉來，把它的皮剝下來做鼓面，聲音震天響。黃帝又派人將雷澤中的雷獸捉來，從它身上抽出一根最大的骨頭當鼓槌。傳說這夔牛鼓一敲，能震響五百里，連敲幾下，能連震三千八百里。黃帝又用牛皮做了八十面鼓，使得軍威大振。
為了徹底打敗蚩尤，黃帝特意召來女兒女魃助戰。女魃是個旱神，專會收雲息雨。平時住在遙遠的崑崙山上。
黃帝布好陣容，再次跟蚩尤決戰。兩軍對陣，黃帝下令擂起戰鼓，那八十面牛皮鼓和夔牛皮鼓一響，聲音震天動地。黃帝的兵聽到鼓聲勇氣倍增；蚩尤的兵聽見鼓聲喪魂失魄。蚩尤看見自己要敗，便和他的八十一個兄弟施起神威，兇悍勇猛地殺上前來。兩軍殺在一起，直殺得山搖地動，日抖星墜，難解難分。
黃帝見蚩尤確實不好對付，就令應龍噴水。應龍張開巨口，江河般的水流從上至下噴射而出，蚩尤沒有防備，被衝了個人仰馬翻。他也急令風伯雨師掀起向黃帝陣中打去，只見地面上洪水暴漲，波浪滔天，情況很緊急。這時，女魃上陣了，她施起神施，剎那間從她身上放射出滾滾的熱浪，她走到哪裡，哪裡就風停雨消，烈日當頭。風伯和雨師無計可施，慌忙敗走了。黃帝率軍追上前去，大殺一陣，蚩尤大敗而逃。
蚩尤的頭跟銅鑄的一樣硬，以鐵石為飯，還能在空中飛行，在懸崖峭壁上如走平地，黃帝怎麼也捉不住他。追到冀州中部時，黃帝靈感突現，命人把夔牛皮鼓使勁連擂九下，這一下，蚩尤頓時魂喪魄散，不能行走，被黃帝捉住了。黃帝命人給蚩尤戴上枷栲，把他殺了。害怕他死後還作怪，便把他的身和首埋在了兩個地方。蚩尤死之後，他身上的枷栲才被取下來拋擲在荒山上，變成了一片楓樹林，那每一片楓葉，都是蚩尤枷栲上的斑斑血跡。
黃帝打敗蚩尤後，諸侯都尊奉他為天子，這就是軒轅（黃帝的名字）黃帝。軒轅黃帝帶領百姓，開墾農田，定居中原，奠定了華夏民族的根基。