黑色的暴雨猛烈地襲擊著這座在黑暗中遭到嚴重破壞的大城市。
這場大雨澆滅了市內幾百處著火點，但是還有一百多處著火點由於火勢過猛，熊熊的烈焰仍在繼續燃燒。在風雨交加中，狂風更助火威，但滂沱的大雨也使人們減輕了對火勢蔓延的憂慮。
不過，儲存在東京灣沿岸的幾萬噸原油、柴油和化學藥品，因洩漏又引起大火。由於火勢太猛，雨水在半空中就蒸騰掉了。因此，這一帶正在慢慢變為高溫缺氧、毒煙瀰漫的無人地帶。高達八至十米的特大海嘯接踵而至，把燃燒著的易燃物卷向四面八方。晴海地區死亡和失蹤的人數之多，僅次於江東地區。大火和水災的襲擊，使芝浦、品川、大井、大森和川崎等沿海低窪地帶幾乎毀於一旦。堆積在晴海、芝浦和品川碼頭上的大型貨物也未能倖免，起火燃燒；被海嘯捲到陸地上的貨輪和燃燒著的油輪，翻倒在人工填築的地段上。首都高速一號線海岸的高架橋橋墩，在被海嘯捲來的浮游物的直接衝擊下，幾乎毀壞殆盡。
位於江東的煤炭裝卸碼頭和夢之島也在燃燒。這兩處地方長時間地冒著濃濃黑煙，給東京海岸的重建工作帶來了極大的困難。
海嘯名副其實地「直接襲擊」了東京灣。洶湧的浪波不僅侵襲了房總半島的館山，三浦半島的三崎、浦賀等地，沿途還襲擊了富津岬，沖毀了富津市的大部分地區。海嘯登陸時正遇上滿潮，更助長了它兇猛的來勢。它一路席捲了橫濱、川崎、千葉等城市，此後，又轉移到東京灣正面的船橋市、浦安町以及江戶川、江東、中央、港品川、大田等多個地區。葛西、砂町、小松川等地勢較低地區轉瞬間就被巨浪吞沒了。荒川的洩洪道發生了海水倒灌，淹沒了千住火力發電站。
這堪稱「第二次關東大地震」，疊加了諸多的不利因素。首先，地震正好發生在傍晚下班的高峰期，也剛好是人們做晚飯的時候；其次是恰逢滿潮；再次是從下午開始一直颳著強勁的南風。新月生成後三天半，潮汐本來算不上大潮，但這一天黎明時分，人工填築地的滿潮水位記錄顯示是二點二米。
海嘯帶來的巨大沖擊，毀滅了可稱為東京心臟和動脈的所有地區。東京電力所屬的豐洲東京火力發電站，品川第一、第二火力發電站，川崎市的川崎火力發電站，潮田、鶴見火力發電站，還有石油、煤氣、造船、制鐵等各行業的工廠、碼頭、倉庫、道路、鐵道、機場等，無一倖免。海嘯輕而易舉地越過防波堤，衝擊泥沙泵澆築的人工填築地，形成泥沙牆，再橫掃沿海岸一線的平坦地帶。在羽田機場，因雷電以及飛機著陸失敗引發的火災還在蔓延，而海嘯又在此刻襲來，一下子吞沒了飛機跑道和飛機庫，地面上的眾多機械裝置也因此遭到破壞。那時恰逢國內航班高峰時段，辦完事準備乘飛機返家的人們和到機場接機的人流，把候機大樓擠得水洩不通。就在這時，緊跟著地震而來的海嘯襲擊了機場，也使高速公路和單軌鐵路瞬間被毀，由於橋樑倒塌，這一地區變成了孤島。附近石油加工廠發生了火災，藉著海嘯向四周蔓延，漸漸地向燃料貯藏庫一帶逼近。好在剛剛投入使用不久的成田機場受災並不是特別嚴重，所以一部分航班轉移到了成田機場著陸。但是成田機場的國際航線關閉，原定著陸成田機場的國際航班開始折返到大阪、首爾、臺北、馬尼拉和香港等地降落。
從伊豆海面返回東京灣的「吉野號」，於深夜十一點多穿過了浦賀海峽。當「吉野號」還行駛在三浦半島海面上時，艦艇上的人就遠遠地望見了相模灣沿岸和浦賀的大火。艦艇剛駛進浦賀海峽，一股說不清的奇特臭味兒就隨著海風被帶到了船上。大約在穿越觀音崎的時候，一直稀稀拉拉下著的小雨突然之間變大了，雨點開始「啪啪」地砸在甲板上，能見度驟然間變得很差。即使如此，在甲板的瞭望塔上，還是可以看見濃煙下面燃燒著的、地獄之火般的熊熊烈焰，火光把北邊的天空映得通紅。
「東京發生了重大火災……」站在小野寺旁邊的片岡小聲說道，「還有川崎和千葉……」
「而且大約在三個小時之前，還遭遇了海嘯襲擊。」小野寺站在艦橋頭，拉了拉橡膠雨衣的帽簷說道，「從傍晚就開始了，我想肯定損失慘重。」
「吉野號」放慢了速度，以每小時七至八海里的航速行駛。大雨中響起了汽笛聲。不知是川崎和橫濱哪個地方附近的液化天然氣還是城市煤氣罐發生了爆炸，忽然間火焰沖天，傳來了振聾發聵的巨響。
「好臭呀！」中田使勁抽動著被雨淋溼的鼻子，緊鎖眉頭，「船暫時駛入橫須賀。雖然橫須賀的街道也被破壞得一塌糊塗，但如果再向北行駛的話，聽說可能會遇到有毒氣體、燃燒的柴油和海嘯遺留的物體殘骸，非常危險呀！」
這時，船身周圍漆黑的水面上，不知從什麼時候起，已經佈滿各種各樣的漂浮物，箱子、榻榻米、汽油桶、木材和其他東西的碎片，甚至還有屍體……
「左舷前方發現漂浮物！」站在船頭的警戒員大聲喊道。
艦艇上的探照燈亮了起來，船頭的螺旋槳轟鳴著，「吉野號」急速掉轉船頭往回開。航行途中遇到一艘數千噸位的沉船。船身絕大部分已經沉入水中，只剩下少許的船身露在水面上。「吉野號」的左舷擦著這艘沉船開了過去。
艦艇在下著大雨的黑暗中航行。突然，對面傳來了隱隱約約的叫喊聲。
「右舷前方發現落水者！」又是警戒員在雨中呼喊。
「向後倒！」船長低聲對大副說著，開啟了艦艇上的通話器開關。
「從右舷放救生艇，營救落水者！」
探照燈掉轉方向，把右舷前方的海面照得透亮。可是除了打在渾濁水面上的光燦燦的雨點外，什麼也看不見。只聽見起放救生艇的「嘎啦嘎啦」的鏈條聲。
「前方好像有不少漂浮船。」正用雷達觀測著洋麵的航海師說道，「可能是被海嘯擊毀的漁船或者是平底貨船。艦艇即將通過第二海炮臺。」
「救生艇回來了……」站在艦橋上的水兵叫道。
「怎麼樣？……找到了嗎？」有人在船舷旁問道。
「找到了……」救生艇上有人說道，「但是……他已經瘋了……」
「田所先生……」小野寺轉過頭對田所博士說——此時，田所正直挺挺地呆站在他身後，連雨衣也沒有穿。「京浜、京葉地區好像受災嚴重。而東京的海岸地帶，幾乎全毀了。」
「這僅僅是開始……」田所博士小聲嘟囔道，任憑雨水打在自己滿是胡茬的臉上，「這……只是個開頭而已……」
「家裡的人不知道怎麼樣了……」片岡落寞地說道，「田町的房子……」