“這是真的嗎？你知道胡克先生說他早已算出，不過不願公佈罷了。親愛的牛頓先生，快將你的證明給我，我要向皇家學會彙報，這是一件天大的事情啊。”

這年12月，在哈雷的鼓動下，牛頓的《論運動》送到皇家學會，二年後公佈有萬有引力的鉅著《自然哲學的數學原理》第一編也送到皇家學會。在審查這些論文的會上，牛頓與他的冤家不得不再次相見。胡克這次不是得意地嘲諷，而是暴跳如雷了，他指著牛頓說：“你這是剽竊我的成果，人家早已解決了的問題，你又來著書立說，真是一種無恥的行徑。”

牛頓拍案而起，這個本來很溫和的教授，今天也控制不住自己：“你自己一事無成，卻好意思指責別人。我倒真想剽竊一點東西，可是你那計算的手稿到如今也不敢拿出來，以至於我真不知該到哪裡去剽竊。我不知一個只知吹牛撒謊的人，怎樣會混到這樣的身份。”

哈雷見事情已弄得很僵，慌忙起來圓場，他在倫敦與劍橋之間已穿梭多次做“紅娘”，今天能有這部書稿擺在案頭，已是成績不小了。他提議說：“我們還是討論一下這部書的出版問題吧。請學會能考慮撥一筆出版費，使這個《原理》儘快問世。”

胡克一聽火冒三丈：“對不起，皇家學會現在經費困難，拿不出一個先令來印甚麼原理。”說完夾起皮包轉身出門，臨到門口，又補了一句：“我宣佈，以後拒不參加任何一次這樣的會議！”牛頓也早已氣得發抖，他將手中的筆往桌上一摔，說：“算了！後面幾編我看也沒有必要再寫了。”

正是：

莫道政界仇難消，學界恨火卻更高。本是一致封自然，偏要你我見分曉。

幾個月後，哈雷又來到了劍橋大學牛頓那間雜亂的房間裡。一進門，他就大聲說：“牛頓先生，請您加快寫作，您的書可以出版了。”

“怎麼，皇家學會又有錢了？”

“不，用不的它的錢，我已借到一筆錢，以個人名義來出版這本書！”

牛頓看這個比自己小十四歲的青年天文學家，一時不知說甚麼才好。他從小孤苦伶仃，頓覺面前的哈雷就像自己的小兄弟一般，忙喊僕人快去拿酒，又摟著哈雷的肩膀在沙發上坐下。哈雷也趕快取出特地為他帶來的資料，說：“牛頓先生，你看，這是格林威治天文臺新測的月球與地球距離的資料，這是巴黎天文臺最新測得的地球子午線資料……”

“啊，好極了，好極了。有了這些，我們的推導、計算就可以更精確了。”牛頓將這些資料捧在懷裡，也不問問哈雷一路是否辛苦，就像餓漢搶麵包一樣地翻閱起來。哈雷也不介意，他接過僕人送來的酒杯，斜靠在沙發上，慢慢地呷味。忽然他的目光停在門下角的兩個一大一小的洞口上，再一看對面通向臥室的那扇門上也有兩個。他用手碰碰牛頓問道：“牛頓先生，為甚麼每扇門下都要開兩個一大一小的洞呢？”牛頓將目光從資料堆裡移過來看了看門，很認真地解釋道：“噢，哈雷先生，你知道我有一隻漂亮的大花貓。為了能讓它自由出入，我在門上開了一個大一點的洞，可是最近它又生下一窩小貓，於是，我又讓僕人再在旁邊開了一個小洞。”哈雷不聽猶可，這一聽，笑得前仰後合，杯子裡的酒也差一點酒到地下。牛頓很詫異，忙問為何發笑。哈雷說：“尊敬的牛頓教授，蘋果和月亮都能同享一個你發現的萬有引力，難道你開的那個大一點的洞，就只許大貓走，而不許小貓走嗎？”牛頓聽完不覺自己也哈哈大笑起來，隨即將資料放到桌上說：“先吃飯，吃飯。”兩人手挽吃手向餐室走去。

1687年夏天，這部科學史上劃時代的巨你《自然哲學的數學原理》終於由哈雷的主持和資助出版了。牛頓對哈雷的幫助非常感激，他在書的前言中特別寫了一段：

“埃德蒙•哈雷，是目光敏銳，博學多才的學者，為本書的出版付出了艱辛的勞動。他不僅為勘誤和製版操勞，而且從根本上來說，他也是鼓動我撰寫本書的人。因為正是他要我論證天體軌道的形狀，正是他要我把這項論證呈報皇家學會。”

《原理》剛剛出版就被搶購一空，以後又接連再版三次（但是牛頓的《光學》一書硬是等到胡克死後的第二年，即1704年才正式出版），這本書的問世可以與歐幾里德的《幾何》，伽利略的《對話》媲美。許多人爭相購買，有人買不到書，竟將這五百頁的鉅著親手來抄一遍。人們狂熱地希望弄懂牛頓提出的新道理。有一位貴族問牛頓：“要讀懂這本書，是不是一定要懂數學？”牛頓答：“除此外，別無它法。”這位貴族立即花錢僱了一位數學教師。《原理》熱一時遍及歐洲。

哈雷出版這本書，原是出於一種對科學事業的正義感。但是他萬萬沒有想到書會這樣暢銷，因此，作為發行人的他也賺了一大筆錢。到底賺了多少，這自然是他的一個不便公佈的秘密。