湖北巡撫胡林翼，奉命派兵援助江西，就派李續賓趕赴瑞州，派文翼趕赴吉安。湖南巡撫駱秉章也派江忠義、王錱趕赴臨江。這時吉安、臨江兩地，仍然在長毛手中。臨江方面，由劉長佑、蕭啟江進攻，相持不下；吉安方面，自從曾國荃去後，各位將領各持己見，互不相容。

剛好江西巡撫文俊被免職，耆齡接替職位，耆齡害怕臨江失守，就一面調王錱趕赴吉安，一面請求起用曾國荃，仍然統領吉安軍。王錱到了吉安，長毛首領石達開的前鋒剛到，兩邊幹了一架，互有勝負。

這位王錱一向很有才名，他自己也是以國家棟梁自居，這時跟長毛的二流部隊打了好幾天，也沒有佔到一點便宜，反而死傷了幾百名士兵。王錱急得吃不下飯，睡不著覺，就這麼生了病，天天在床上呻吟。忽然有人報告說，石達開親自來了，整個部隊都慌了神，急忙報告了王錱，急得王錱冷汗直流，轉眼間口吐白沫，去見閻王爺了。幸虧曾國荃及時趕到，軍心才穩定下來。

曾國荃立刻帶兵去攻擊石達開，石達開是太平軍裡了不起的軍事家、政治家，因為韋、楊窩裡反，又加上洪秀全不信任，非常悲憤，這才帶領孤軍出來。他哪有心思打仗？等到了吉安，看到曾國荃軍容整齊，他就不戰而走，先來的長毛因為後面的長毛無緣無故地撤退，自然也跟著一鬨而散了。走得慢的，被曾國荃追上，殺死幾百人。等到長毛走遠了，曾國荃仍然回來圍攻吉安。

這時楊、彭二將圍攻九江，已經將近一年，守城的悍匪林啟榮多次出兵過來攻打，都被楊、彭打敗。他就一意固守，毫不鬆懈，楊、彭二將倒也無計可施。就因為這個，外江內湖的水師被阻三年，仍然不能來往。

楊、彭商議了好多天，由彭玉麟提議，主張攻打石鐘山。石鐘山是江湖的要口，長毛布置得非常嚴密，作為九江城的保障，所以湘軍內外隔絕。楊、彭二人懸軍於九江城下，左邊要防著九江，右邊要防著石鐘山，兩面兼顧，處處受限制，於是就決定攻打石鐘山，秘密地派人去通知內湖水師，裡應外合，又和陸軍統領李續賓商定了密謀，讓他依計策行事。

發兵的這一天，內湖水師先冒死衝出湖口，依山列陣，長毛沒有一天不提防他們出來，自然率人防禦。但長毛裡也有能人，一是害怕楊、彭夾攻，二是害怕李續賓也舍陸上船，過來接應。等打聽到李續賓已經在這之前就帶人趕往宿太等地方去了，長毛於是就一心一意地防禦兩面水師。楊、彭二將，聽說內湖水師已經出了湖口，立刻把戰船分成兩翼，划船快速前進。

這時山上山下的長毛已經開始分頭抵擋，這邊剛開始渡江，那邊已經斷流了，兩軍一接仗，都把性命丟到了九霄雲外，惡狠狠地拼殺。從上午一直打到傍晚，足足打了七八個小時，喊殺之聲就從來沒停過。兩邊互不相讓，你殺我，我殺你，一直殺到風雲變色，天昏地暗。

猛然看見山上著了火，火光映照著水面，就像一條火龍一樣，頃刻間煙霧瀰漫，江水都被映照成了紅色。長毛全都驚慌失措，再去看山頂，已經變成了火焰山，就算渾身是膽，到這時候也不寒而慄。長毛撤退，湘軍趁勢攻過來，把長毛殺得四分五裂，如摧枯拉朽，還沒到天明，就已經繳獲戰艦八十九艘，炮一千二百尊，殺死長毛一萬多人。外江內湖的水師，合併成了一支。

這一場惡戰，要不是李續賓假裝趕赴宿太，乘夜渡江，繞到石鐘山後，登山放火，水師也不一定就獲得這麼大勝仗。楊、彭二人天明收軍，檢點部下，死了五分之一，傷了五分之一。後來由曾國藩上報上去，就在石鐘山上建了昭忠祠，就是因傷亡太多，所以樹碑紀念。

攻克了湖口，下游六十里處就是彭澤縣。彭澤縣南面有個小孤山，也是挺立在江中，長毛佔據高處當堡壘，依據南北兩岸，修築了石城，挖了一遭壕溝，又暗地裡弄了機關，以此守衛彭澤縣，作為九江的聲援。長毛首領賴漢英，踞城防守，已經有四年了。楊載福帶領合軍，到達彭澤縣南岸，命令士兵登岸，假裝安營紮寨，擺出一副打持久戰的架勢。長毛出來攻擊，士兵紛紛逃跑了。長毛爭先恐後地追趕，一直到急水溝，突然聽到一聲號炮，萬馬奔騰，楊載福親自率領大軍從長毛背後殺過來。長毛知道情況不妙，但撤退已經來不及，沒辦法只好跟楊軍接戰，無奈後面又來了人，把長毛衝成幾塊。長毛心慌意亂，都是保命要緊，各自為戰，逃回城裡。楊載福帶兵殺過來，殺死俘虜了很多長毛，接著立刻圍住彭澤城，四面攻打了一天。

第二天撤退兩面，只從西、南兩面猛攻，長毛首領賴漢英也讓長毛全力抵禦，從早上一直到傍晚，兩邊計程車兵都有些疲憊了。攻城的戰士漸漸開始鬆懈，守城的戰士也漸漸開始放鬆。賴首領還以為沒事了，沒想到城東面突然有清兵開始登城，拔掉了賴首領的長毛旗，換成李將軍的清軍旗，嚇得賴首領手足失措，只好招呼部下，開啟北門，一溜煙逃跑了。

楊軍單攻西南，留出東北兩面，一面是為了約李續賓晚上偷襲，一面是放賴漢英逃跑。賴漢英出了彭澤城，打算逃往小孤山，到了江邊，四處一看，連聲叫苦，正想轉身逃跑，沿江已經有清兵殺過來了，喊殺的聲音震得江水都晃動，不知道有多少清兵。幸虧賴漢英急中生智，脫了帽子和衣服，這才一溜煙逃掉了。剩下的部隊被清兵殺得一個不留。

楊載福攻城時，彭玉麟已分兵攻打小孤山，奪山破城，正是同一天，前後只相隔了幾小時。賴首領逃到江邊，上山下水都已經掛上了彭字大旗，這時候除了換身衣裳逃跑，也沒有別的辦法了！楊、彭、李接連攻下要害，掃清了九江上下游的敵壘，於是專心一致地攻打九江。

這時候，和春、張國樑從丹陽合兵，又進攻南京周圍的縣，接連攻克句容、溧水等城，再次逼近鎮江。鎮江是南京的犄角，上次餘、吉二人圍攻了鎮江很久都沒有作為，就是因為南京多次出去支援，所以才導致失利。

這次張國樑來攻打鎮江，仍然用吉爾杭阿的老法子，親自率兵在高資駐紮，扼制敵人的糧道，長毛多次來爭奪，都被張國樑竭力抵擋住了。長毛打一仗敗一仗，接連敗了四次，這才不敢再來進攻張國樑，只是佔領運河北岸，建造堡壘來抗拒。可見吉巡撫的計策並不是不行，就是自己的兵力太弱了，所以才出現這樣的差異。

張國樑也不敢去硬拼，就休息了幾天，暗地裡約定總兵虎嵩林、劉季三、餘萬青、李若珠等人合力攻城。鎮江的長毛，被以前的勝利衝昏了頭，沒有防範，等到四總兵帶人攻過來，如狂風驟雨一樣，長毛大驚，急忙帶兵防禦，開炮扔石頭，忙個不停。無奈顧了東顧不上西，顧了西顧不上東，正在走投無路的時候，張國樑的大旗已經順風飄過來了。長毛看了大旗，更加緊張，清兵卻更起勁了。清兵乘勝攻進了城，只是沒有抓到長毛首領吳知孝，追到江邊，也沒有找到蹤跡，大概是突圍逃跑了。

張國樑收復了鎮江城，德興阿也收復了瓜洲。原來德興阿防守揚州，聽說鎮江的長毛跟清軍相持，知道江南的長毛無暇兼顧江北，就命令士兵進攻瓜洲，四面包圍，把土城給攻破了。長毛無路可走，大部分都被殺死了。有幾十上百個長毛竄到城外，又被清兵水師截擊，全都淹死了。

南北捷報相傳，和春、張國樑仍然打算進攻南京，又組成了一個江南大營。事有湊巧，江西的臨江府也由湖南派來的援軍一舉攻進去了。劉長佑積勞成疾，請了個長假。知府劉坤一代替主持行政工作，跟蕭啟江軍一塊兒趕赴撫州，江西大部分一舉平定，眼看九江一帶不久也能平定了，沒想到內亂剛有轉機，外患又跟著來了，廣東省又出了事。廣東的禍胎，來自於和事老耆英。英商進城的事，被廣東總督徐廣縉一個人給搞定，英國大使文翰，這才答應不進城，廣東安靜了幾年。

長毛開始造反，廣東也沒有被波及，只有徐廣縉調任湖廣後，巡撫葉名琛就升為總督，恰好英政府召回文翰，改派包冷來華。包冷又請求英商進城，葉名琛不答應，包冷多次來騷擾，葉名琛都沒有搭理。有時就連英人詢問其他的事，他也都放到了一邊不理。清政府一看廣東這幾年一直沒事，還以為他真有什麼大才能，就任命他為體仁閣大學士，讓他留任廣東，葉名琛更加自負了。

咸豐六年，英政府又派巴夏禮擔任廣東領事。巴夏禮又來請求進城，葉名琛仍然用老法子，一個字也不回覆。巴夏禮也是個自負的人，這次鬧了個大窩脖，就日夜找茬，打算進攻廣東。正趕上東莞縣有會黨作亂，按察使沈棣輝、督官紳兵勇把會黨擊退。沈棣輝列舉了一下自己的戰功，請葉名琛幫忙給上報一下，葉名琛也扔到一邊不理。從此軍心渙散，任由土匪來去自如。會黨首領關巨、梁楫等人逃到海島，加入了英國國籍，給巴夏禮出謀劃策，請他攻打廣東。巴夏禮就訓練水手，等待時機下手。

不是冤家不聚頭，海外來了一隻洋船，掛著英國旗幟，船裡卻都是中國人。巡河的水師懷疑是漢奸投靠英國尋求保護，於是登船搜查，把英國的大旗都給扔了，又把船上的十三個人全部給鎖起來，押解到省城，說是抓到了土匪。

葉名琛也沒有管他真假，就交給下面處理了。突然接到巴夏禮發來的信件，葉名琛有意無意地接過來一瞧。信上說，你們的水師，無緣無故搜我們的船，實在沒道理。船裡的人，不是你們中國的逃犯，就算是你們的逃犯，也應該帶著搜捕令才行，不能隨便抓人。至於毀壞我們的國旗，侮辱我國的榮譽，更是讓人匪夷所思。

葉名琛看完以後，就說：「我還以為什麼大事兒呢？不就是來要那幾名水手嗎？嘮嘮叨叨地說了這麼多，誰有這個閒工夫跟他扯淡？」接著找來巡捕，讓他關照下面的縣級單位，把這十三個水手給放了，送去英國大使館。

沒想到，到了第二天，去的人回來報告說：「我們昨天把十三名水手送回去，結果人家的大使不見我們，只是讓翻譯跟我們說，這事兒既然牽扯到水師，就不能這麼拉倒！」

葉名琛說：「愛咋地咋地，把十三個人再關起來吧，不用管他們！」小縣長答應一聲回去了。

沒出三天，水師負責人就派人報告說，英國艦隊正在進攻黃埔炮臺。葉名琛說：「我又沒想惹事兒，他們為什麼攻我們的炮臺？」好像做夢一樣。

正在驚訝的時候，雷州府知府蔣音卬到省裡求見，葉名琛就把他請進去了。葉名琛來不及問他來省城為什麼，就先把英國人鬧事兒的情形詳細說了。

蔣知府說：「根據我的意見，還是先向英國大使那兒問清楚情況，再想辦法對付的好！」

葉名琛說：「老兄說得有道理，就請老兄去一趟吧！」

蔣知府不好推辭，就去拜見了英國大使。相見以後，英國艦隊的船長也參加了會議。蔣知府就把總督的命令說了一下，問他們為什麼無緣無故地挑釁？兩個人一起回答說：「這都是謠傳，就因為這個，曾多次損害我們兩國的感情。請知府大人回去告訴總督，就說一切事情等進了城以後再談。」

蔣知府回去報告了葉名琛，葉名琛說：「前任總督徐廣縉已經跟英國人約定好了，洋人不能進城，這事兒怎麼能通融？」蔣知府不敢多說，當下退出去了。

巴夏禮又來詢問會面的日期，葉名琛都以不能進城為由，謝絕了來使。巴夏禮再次請求進城相見，葉名琛仍舊沒有理睬。

於是巴夏禮招集英兵，由船長率領，進攻省城，只聽一片炮聲，震天動地。葉名琛不是調兵守城，而是念叨什麼救苦救難大慈大悲觀世音菩薩。巡撫柏貴、藩司江國霖急忙趕來，詢問退敵的計策。

葉名琛說：「不要緊！洋鬼子來了咱就跟他講道理，有什麼可害怕的？」

柏貴說：「就怕洋鬼子不講道理。」

葉名琛問：「洋鬼子到底有多少人？」

柏貴說：「聽說有一千來人。」

葉名琛微笑著說：「才一千來人，能頂什麼用？現在咱們城裡的軍民加起來，可有幾十萬人，就算十個打一個，也是咱們人多。你沒聽說徐廣縉一個人赴約的故事嗎？英國大使文翰看見兩岸有幾萬軍民，就嚇得知難而退了，何況咱們現在有幾十萬。他如果來了，肯定也是嚇得灰溜溜地跑！」話還沒說完，就聽見一聲怪響，接著又是無數的聲響，柏、江兩人都嚇得不輕，外面有士兵跑進來說，城牆被轟塌了好幾米。