兩年之後，他不顧聯盟內的諸多反對聲音，悍然動用龐大的太空戰堡，噴火龍軍團、快龍軍團、水母軍團、古代三大軍團……開始強行收服神獸之旅。

先是最後的一隻三聖鳥：急凍鳥、其後深海守護神獸洛奇亞、世界起源守護神獸夢幻。再其後，他將爪牙伸向成都地區，先後收服炎帝、雷公、水君、通過燃燒園朱市的鳳王巢穴玲玲塔，引來憤怒的鳳王，收服之。

擁有了三聖鳥、洛奇亞，胡飛便在三聖島設立軍備重鎮。然後通過三聖鳥影響天氣，洛奇亞影響洋流，操控整個地球的天氣氣候。一邊利用氣象變幻，打擊成都、豐緣、神奧地區的經濟，另一邊動用關東聯盟、火箭隊的力量進行或明或暗的滲透。

此外，採集洛奇亞身上的銀光之羽、鳳王身上的彩虹之羽，構造出能夠捕捉時間轉移神獸雪拉比的gs時間精靈球。於月圓之夜，在桐樹林的小廟附近，收服了森林守護神獸雪拉比。

利用雪拉比，胡飛回到過去完成了柳伯的心願之後，這位冰天王實力的老人卻摘下了冰魔面具，歸隱山田去了。

又是一年之後，阿露福遺蹟之中。

阿露福遺蹟，是從古代儲存至今的，擁有1500年曆史的寶貴遺蹟。在這裡面生存著不是神獸的神獸，過去一直是一個謎，被叫做象徵神奇寶貝。

沒有錯，它的學名便是未知圖騰。

胡飛一身風衣，銀色面罩，如槍桿一般筆直如松地站在遺蹟的大廳之中。

「這些牆壁上的如文字一般的記號，其實就是有生命的未知圖騰了。」胡飛環顧四周，緩緩張開雙臂。體內的武神魂默默運轉，令精神石板散發出幽蘭色的光輝。深邃的藍光透過胡飛的身子，撲灑在整個空蕩幽古的遺蹟牆壁上。

片刻之後，牆壁上一個個的宛如文字一般的，黑色圖騰活躍起來。跳出牆壁，懸浮在胡飛的身邊，組成一個個玄奧繁複的文章圖案。

「這是？！」胡飛一驚。他的意念通過精神石板，散發到成百上千的未知圖騰身上，居然被無限地增強，再增強。散出地球，穿過這一片的宇宙，然後武神魂劇烈地消耗起來，神念擴充套件至無限遠，穿越了空間屏障。將這個神奇寶貝世界的空間構架一覽到底。

真實的神奇寶貝世界，有五大球狀空間組成，世界體系相當的簡單。

創世神拉斯尤斯佔據主要的棕紅球形空間。正在沉睡。

時間之神迪亞魯加居住在深藍球形空間之中，空間之神帕魯奇亞佔據粉紅球形空間。且共同管理著現實世界

冥王龍主持著墨綠色的反轉半球形世界。它是唯一生活，也是能生活在反轉世界的神奇寶貝。反轉世界的出現是為了支撐現實世界，在現實世界受到的汙染會分攤到反轉世界，以保持現實世界的平衡，汙染物在反轉世界會表現為有毒的黑雲。

至於人類這居住在相對最小的湛藍色的球狀空間之中，即現實世界。在這個空間中的宇宙以星球的形式存在著，其中的一顆星球——地球上生活著無數只的神奇寶貝。