拜等人不由破口大罵，罵這些蒙古人陰險怯弱，不講道德，不講誠信，真真是靠不住。罵了半天沒辦法。眾人只得垂頭喪氣地回到寧夏鎮城。

形勢不妙，拜招集叛軍將領們商議，拜假意將責任都推到自己身上，眾叛將感動。劉東言城內糧草眾多，又有幾萬叛軍，只要堅守城池，就會有奇蹟出現，同時可以蒐羅城內地金銀珠寶，再請求河套的蒙古部落出兵。

許朝也是拔刀砍下桌角，言道有欲降者。便如此桌。當下眾叛將歃血盟誓，同生共死。拜又派人帶著大批的金銀財物，鼓動蒙古各部落出兵。

由於平虜堡參將蕭如薰孤城抗賊，名揚西北，萬曆皇帝得知後十分歡喜，特別給予豐厚的獎賞。擢升他為寧夏鎮副總兵官。

到這時候，寧夏叛軍外圍盡去，三月三十日，李率六路大軍完成對寧夏城地包圍。

四月五日，叛軍急開東、北二門，各出精騎2000出城搏戰，另派步卒列火車為營，實施防禦。官軍發起攻擊。奪叛軍火車百餘輛。叛軍淹死於城壕內無數。此時吊橋未及拉起，延綏副總兵王通帶著一個親兵，名叫高丁的好漢，趁機殺入北門，不過餘者的榆林鎮官兵不敢跟入，只有王通二人殺入城門。****土文秀一箭射中王通額頭，那親兵高丁忙將王通救了出來，叛軍也趕快拉起了吊橋。

眼見朝廷重兵雲集。拜夫人施氏責備拜有福不享，非要弄險。承恩大怒將繼母施氏一把推跌在地，恨恨而去。拜此時也是憂心忡忡，與許朝等人商議招安一事。

魏學曾正愁糧草不繼，想要退軍就食，又擔心叛軍突圍出去，投奔蒙古人。那時就遺患無窮。遂將計就計。下令停止攻擊。並經常以上司對下屬的口氣，行文斥責拜等人。拜見朝廷還以屬部相待，更是放心。

幾日後，土文秀，許朝二人出城商量受降條件。承恩、劉東見官軍乏糧催餉，遂率精騎潛至漢延渠，奪得官軍糧餉二百餘車，阻斷官軍補給，叛軍士氣又燃燒起來。

四月二十一日，官軍再次組織攻城。不過因拜挾持慶王及隨府穆來輔等官員，堅守寧夏鎮城，連著攻城一月有餘，毫無建樹。此時拜又請求於著力克，著力克又組織蒙古各部，襲擾寧夏鎮邊境，大大增加了平叛地難度，明軍難以應付，魏學曾在往靈州途中被賊圍剿，幸救而得免。

魏學曾久攻不下，於是向萬曆帝請求以招安為主，平息戰亂。萬曆帝大怒，特旨擢升蕭如薰為寧夏鎮總兵官，統一指揮延綏、甘肅、固原諸路征剿大軍。又調猛將麻貴為副總兵，帶兵前往助戰。並賜魏學曾尚方寶劍，有畏敵避戰者先斬後奏，並授旨他：「殺知府以下將官不用命者，不必上請」。

猛將兄麻貴到了寧夏，與蕭如薰幾番組織大軍攻城，都未能得手。五月二十九日夜，蕭如薰、麻貴乘風縱火，架雲梯攻城。叛軍以滾木壘石還擊，官軍死傷千數。魏學曾見強攻不克，遂採用離間計，企圖從內部突破，未果。

此時萬曆帝已對魏學曾不滿：「堂堂天朝因麼麼小丑遣兵累月而未奏蕩平，豈不辱國？」

朝中也多有紛議，認為魏學曾乏應變之才，無力剿平禍亂。浙江道御史梅國楨上奏萬曆帝道：「麻貴雖勇卻不敵李如松，懇請起用如松，定可收到奇功。」

顧秉謙密奏道：「李成梁父子久鎮邊關，飛揚拔扈，不受方鎮節制。切勿前門拒狼，後門迎虎。」

萬曆帝有些猶豫不決，朝議有人認為李成梁父子兵權過重，李成梁不宜再握兵權。科臣王德完認為梅國楨舉薦失當，存有私心梅國楨為表心跡，自薦願同李如松前往寧夏平叛，並上疏道：「李氏父子當防之於遼東握兵之時，而不當防之於廢棄離任之後。」

又表明自己的心跡，道：「臣自外吏入廁臺班，雖懷狗馬之心，未效涓埃之報。若疑徒市私恩，不顧國計，願與成梁馳赴寧夏，同心討賊，不必加以別銜，假以重任。」

此次上疏，梅如願以償，得到萬曆帝許可：「奉聖旨，梅國楨就著同李如松前去監軍，並紀錄功次。」

當時李如松為宣府總兵，由於軍情緊急，萬曆帝急令他為提督陝西討逆軍務總兵官，並抽選遼東鎮，宣府鎮，大同鎮，山西鎮各路人馬約三萬人，由李如松統領，一起前往寧夏鎮平叛。李如松也是大明朝中後期唯一一個由武臣擔任提督者。

接到聖旨後，李如松如雨般地發出公文，要各路人馬，遠的來宣府集中，近的原地待命，又任命自己兄弟李如柏為先鋒官，李如樟督運糧草，先期開赴前線。

與此同時，甘肅巡撫葉夢熊也主動請纓，願意協助魏學曾平叛，他可出神炮火器戰車四百輛，苗兵三千，自備糧餉前往寧鎮平亂，皇帝壯其志，命其前往助戰。浙江巡撫常居敬也主動請纓，願自選一千精兵前往，也得到朝廷的嘉許。由於山西鎮也在出兵之列，而山西鎮最能打的就是副總兵黃來福麾下地人馬了，很快，黃來福接到兵部地公文，要他出兵兩千，隨同李如松一起出戰。

這可是個宣揚五寨堡地好機會，當下黃來福管轄的五寨堡和老營堡，都是緊急動員起來。