凌霄在有熊部落附近的一座山上開闢了個臨時洞府，平時無事，盡力教導軒轅和女娃。時間一晃就是十八年。

兩年前，少典去世，軒轅繼任有熊部落的族長之位，這一日，有熊部落來一人，手持赭鞭，揹著一個竹筐，皮膚黝黑。正是遊歷洪荒的神農。

神農三年前將多年行醫的經驗和醫理編製成書取名叫做《神農百草經》，此書一成，神農只覺心中空靈一片，心知大道已成，便四處遊歷洪荒，一邊傳授丹道醫理，一邊尋找自己的接班人。

直到今日，來到有熊部落，聽說軒轅被人族聖祖凌霄收為徒弟之時，便知道軒轅十有八九便是自己要找之人。

叫人去將軒轅請來，軒轅得知是共主神農前來，急忙恭敬的迎接進部落之中。

屋內，神農見軒轅丰神俊朗，生的是一表人才，心中甚是滿意。笑道：「聽聞軒轅部落出了一位大賢，福緣深厚，竟然拜在聖祖凌霄門下，吾心甚喜，今日一見，果然名不虛傳。」

軒轅謙虛道：「皆是師父教導有功，軒轅不敢居功，倒是聽聞共主種五穀而飽天下，養六畜而興天下，治丹藥而醫天下，乃是繼天皇伏羲之後的又一位大賢，心中嚮往已久，今日得見，吾心足矣。」

神農與軒轅坐下後，因為一拜玄都為師，一拜凌霄為師，又都是天定三皇之一，互稱兄弟，聊得甚是投機。

神農問了軒轅一些有關民生部落管理之事，軒轅對答如流侃侃而談，時而發表自己的見解，不少見解讓神農眼前一亮，久聊之下，發現軒轅果真學識淵博，便表示了自己的退位讓賢之意。

軒轅心懷天下，也不推脫，二人商議三個月後，舉行接位大典。

神農本來打算去拜見凌霄，卻被凌霄傳音告知三月後，自會相見作罷，回到陳郡，便開始安排傳位之事。

三個月後，到了神農證道的日子，陳郡站滿了前來管理的人族，高臺上供奉著聖母女媧娘娘，聖祖凌霄道君，三清教主和天皇伏羲，凌霄身為軒轅的師父，又為人祖便趕了過來。

玄都是神農的師父，也站在高臺上觀禮，神農走上臺，忽然間天光大亮，一架有九匹龍馬所拉的輦車自天外飛來，一聲朗笑自攆上傳出：「這些年來辛苦皇弟了，如今皇弟證得地皇道果，真是可喜可賀啊。」

凌霄和玄都聽得清楚，知道是天皇伏羲來了，神農一見是天皇伏羲來了，急忙迎接，一番見禮之後，玄都大法師取出三清符詔朗聲念道：「奉玄門三清天尊敕令，人族共主神農自接任人皇以來，天下大治，務利至己矣，不望其報，不貪天下之財，而天下共富之；不以其智慧自貴於人，而天下共尊之。今可得道，飛昇火雲宮，當歷無量量劫不滅！另著人族公孫軒轅繼位。」

神農拜了三拜，雙手接過三清符詔，與軒轅一起登上高臺，拈香拜了三清女媧和凌霄三拜，朝下方人族高聲道：「神農自自成為共主以來不敢有絲毫懈怠，天幸如今下任共主已出，神農也可放心離去，今日神農禪位，天下共知！」言罷從袖中取出人皇至寶崆峒印，又摘下頭上的九龍星辰冠，捧著來到軒轅面前，表情嚴肅地說道：「軒轅，今日我把人族的未來交到你的手中，你定要將我人族帶領壯大，莫要辜負了聖祖期望！」