不一會，秦瓊被帶上堂來，依舊跪在原地。
楊素看著秦瓊說道：「秦瓊，以你違抗軍令、頂撞主帥這兩條來說。那一條都足夠老夫將你斬首示眾。不過念在你也立下了不少的功勞，且有眾將為你求情，老夫就饒你一命。」
秦瓊忙說道：「多謝大總管不殺之恩。」又轉身對眾將拱手一禮，說道：「多謝各位同僚相救之情。」
楊素在秦瓊謝過軍中一眾同僚之後，又開口說道：「不過死罪可免，或最難繞。老夫給你三十軍棍，讓你長長記性。」說完便命親兵再次將秦瓊帶出去。
史萬歲、李達等人還準備再次為秦瓊求情，讓楊素免去秦瓊這三十軍棍。就見楊素臉一板，擺手說道：「三十軍棍已經是輕饒了秦瓊，你等不必再為他求情。」
眾將見楊素主意已定，而且三十軍棍雖然難熬。但是以秦瓊的身體，捱上三十軍棍也不至於傷筋動骨，便都不再求情。
不一會，三十軍棍便打完了。秦瓊在楊素親兵的攙扶下走進大堂。
軍中的三十軍棍可不比一般縣衙的板子，三十軍棍是有可能打死人的。而且行刑的親兵也沒有徇私。三十軍棍沒一棍都是實打實的打在了身上。
以秦瓊的體質也有些站立不穩。
楊素見秦瓊的屁股上一片通紅的血跡，也有些不忍心。畢竟像這樣有天賦的年輕人並不多見，每一個都有可能成為大隋日後擎天柱、架海梁。不過這樣的磨礪對他以後還是有好處的。
點點頭對秦瓊說道：「今天給你一個教訓，讓你記住。你是一個將領，而不是士卒。作為一員將領雖然需要勇猛，但是更加需要冷靜和智慧。」說完便轉身離開了。
而秦瓊再次謝過眾將之後，便在李達的攙扶下離開大堂。回自己的房屋歇息去了。
秦瓊回到屋中，趴在床上，不敢動彈。
李達將秦瓊的小衣揭開，看著秦瓊變成一片爛肉的屁股。有些惱怒的說道：「楊素那老頭也真夠狠的，竟然將叔寶你打成這樣。」
秦瓊一邊忍痛讓李達清洗傷口，一邊說道：「鐵牛，你也不要怪大總管。大總管也是為我好。讓我長一長記性，記住自己是一員將領，而不是普通計程車卒。
如果沒有這件事，我可能還發現不了身上的問題。長久下去，會變得極為的嚴重我可能永遠也成不了統帥千軍的大將。」
李達一邊清洗傷口，一邊說道：「他既然發現了你的問題，直接告訴你就行了麼。何必一定要打你？現在打成這樣，你怎麼上陣？」
秦瓊苦笑一聲，說道：「也是我太過狂妄，在軍中一眾同僚面前頂撞大總管。軍中統兵最重的就是威信，我的行為已經影響到了大總管的威信。
為了以後順利的統兵，大總管必須懲罰我。不然以後大總管怎麼號令三軍？」
兩人正在說話，就見一名士卒走進來，說道：「稟告兩位將軍，上開府儀同三司（從三品上）史萬歲史大人到了。」
秦瓊聞言忙說道：「快快有請。鐵牛你代我出去迎接史大人。」
李達為秦瓊蓋上被子，便出去迎接史萬歲了。
史萬歲走進屋子，來到秦瓊身邊，對秦瓊說道：「叔寶，傷勢如何？」
秦瓊沒有先回答史萬歲的問題，而是對史萬歲說道：「叔寶多謝大人相救之恩，請恕傷勢在身無法起身。」
史萬歲笑道：「無妨，本官事來看叔寶的傷勢的。」
說完揭開被子看了一下秦瓊的傷勢，說道：「還好，大總管還是手下留情了。傷勢並不重，以你的身體有半個月就能再次上陣了。」