光緒皇帝收到徐致祥彈劾張之洞的奏摺，這是他親政後要處理的第一件大事，讓年輕的皇帝頭疼不已。帝師翁同龢在身邊打小報告，說張之洞這人人品確實不咋地，而且地位遠不如李鴻章，可以查辦。但光緒皇帝很糾結，他心裡很清楚，張之洞也是慈禧太后欣賞的漢臣，他動不了。貿然動了，親爸爸肯定是要怒的。
光緒皇帝四歲進宮，對「親爸爸」慈禧的母老虎發威是有心理陰影的。打光緒進宮開始，慈禧就千叮萬囑必須教導光緒皇帝稱她叫「親爸爸」。慈禧太后對待光緒極端嚴厲，光緒小時候，慈禧每天都要訓斥他，管他皇帝不皇帝的，在她眼中，光緒就是一個小屁孩，有時甚至還要鞭打他，或讓他長跪不起。光緒有時候讀書不夠用功，慈禧就對著跪在她面前的小皇帝大聲訓斥，嚇得光緒渾身顫抖。
徐致祥彈劾張之洞時，張之洞已得到李鴻章的支援和慈禧的首肯，由兩廣總督調任湖廣總督，光緒皇帝聖旨都下了，張之洞明顯屬於二品以上的封疆大吏，按例涉及二品以上的人事，光緒皇帝要請示慈禧太后。
早在光緒十二年，也就是1886年，光緒皇帝虛齡16歲時，按中國傳統觀念，他已成人，具備了「披閱章奏，論斷古今，剖決是非」的能力。當年六月初十日，慈禧太后頒佈「懿旨」，著欽天監選擇吉期，為光緒皇帝舉行親政典禮。
對慈禧這一決定，光緒皇帝的老爸醇親王奕譞很心慌，他二十年多前就和慈禧一起搞辛酉政變，殺了肅順等人，知道慈禧心腸毒辣，喜歡權力勝過任何一切。儘管「牝雞司晨，不祥；女主當權，國危」是中國幾千年封建社會根深蒂固，慈禧作為一個女人，卻把持清廷最高權力數十年，使滿漢王公大臣及中國的四億之眾拜倒在其裙下，她很享受這種快感，絕對不可能輕易交權。
思前想後，醇親王奕譞以退為進，在慈禧太后準備讓光緒帝親政的「懿旨」頒佈後僅五天，就上奏稱與各位王大臣審時度勢，合力懇請慈禧太后從垂簾聽政改為「訓政」，並表示皇帝「將來大婚後，一切典禮規模，鹹賴訓教飭誡」。
醇親王當時剛取代恭親王，知道自己的權力是慈禧給的，所以在訓政上破費了心思，他提出訓政的模式：「必須永照現在規制，一切事件，先請懿旨，再於皇帝前奏聞」。
慈禧太后本來也沒準備這麼快歸政光緒，只是那幫清流大臣在耳邊唧唧歪歪，聽得心煩，才表示要讓光緒皇帝親政。此時光緒的老爸提出還可以「訓政」，她自然心裡很高興，順水推舟，表示接受奕譞的訓政請求。這年十月，禮親王世鐸就跳出來，就訓政的細則奏報慈禧太后允准，其中一條是「凡遇召見引見，皇太后升座訓政」，也就是皇帝要召見誰，皇太后還要去看著，這就讓慈禧牢牢把握了「人事大權」。慈禧的權力實質上與垂簾聽政並沒有什麼區別。
按照《訓政章程》，訓政期間慈禧仍然可以在召見內外臣工的時候升座，前面設紗屏為障，凡是臣工的升降罷黜的人選，仍然按照垂簾時候的規矩，都要太后自己審閱，由太后釋出懿旨，由內外臣工奏下。
到了光緒十三年，光緒又長大了一歲，慈禧太后便強行把自己的內侄女、都統桂祥女葉赫那拉氏嫁給光緒做皇后，即後來的隆裕太后。慈禧的侄女跟光緒帝是表親關係，比光緒帝大三歲，是嫡親的大表姐，小時候經常進宮，跟光緒帝玩過遊戲，算是童年的玩伴之一。
光緒帝做夢都想不到，這麼醜的表姐，會成為皇后的候選人，她其實就是「剩女」，二十一歲還沒有找婆家，身高不矮但有些駝背，臉型不短卻時常哭喪著臉，沒有一點兒討人喜歡的地方。按當時的標準，女子二十一歲是個應該隱諱的年齡了。光緒帝在洞房中撲在既是表姐又是皇后的隆裕懷裡痛哭流涕，然後例行公事，估計床上的滋味也不爽。不過慈禧為了安慰光緒，還是給他選了兩位「姊妹花」——瑾嬪和珍嬪進宮。
幼帝一經大婚，便要親理朝政，這是大清國的祖宗之法，慈禧再強勢，也只好搬出皇宮到頤和園去「頤養天年」。為加強對朝廷控制，慈禧在文武官員的安排任命上多用對其效忠之人。為便於把握光緒帝的動向，慈禧將光緒帝讀書的書房由毓慶宮改在頤和園附近的西苑，要求光緒帝每日到頤和園向她請安，親政後的光緒帝必須將朝中大事向她「稟白而後行」。光緒每天要到慈禧住處請安，有時中午還要陪慈禧看戲。
儘管慈禧太后仍不斷以各種方式箝制著他，然而作為一個年輕人，光緒皇帝總還要施展一下自己的政治抱負，他與慈禧太后之間的矛盾與衝突已經不可避免。光緒皇帝能依仗的，就是以翁同龢為首的「帝黨」，尤其是在光緒帝親政之後，皇帝「每事必問同龢，眷倚尤重」。
翁同龢的家世其實很顯赫。江蘇常熟翁氏家族，父子宰相，同為帝師；叔侄聯魁，狀元及第；三子公卿，四世翰苑。翁同龢自己還是咸豐六年狀元，先後為同治、光緒兩朝帝師，歷任刑部、工部、戶部及吏部尚書，軍機大臣兼總理各國事務衙門大臣，在晚清政壇舉足輕重。
翁同龢在朝中有一個辦洋務的政敵李鴻章也就夠了，這時候冒出一個張之洞，跟在李鴻章屁股後面要修鐵路，翁同龢當然不能容忍。他建議光緒皇帝立即指派原來的湖廣總督李瀚章徹查張之洞。
翁同龢選人查辦張之洞是有講究的和考慮的：李瀚章剛被從富裕的湖廣地區調到了不願意去的兩廣，肯定不會包庇張之洞，而且李瀚章是李鴻章的哥哥，就算不扳倒張之洞，也至少可讓李鴻章和張之洞鬧翻。
張之洞這次被彈劾，提供黑材料的就是他的學生周錫恩，曾是張之洞得意門生。張之洞過生日時，周錫恩送給他一篇抄襲之作為賀禮，張之洞開始以為這文章牛氣沖天，特地裱了掛在自家客廳，後來經人提醒才知是怎麼回事，自此疏遠了周錫恩。周錫恩因此懷恨在心。
張之洞感覺不妙，專門進京，到湖廣會館設宴請李經述出主意，陪同的還有山西協同慶票號的老闆劉慶和。