林青玄改司教院為佈道院，佈道院管理玉泉門下屬所有佈道場，負責弟子的招收，最初五年的教育。
認命丘平為佈道院院長，直接向掌門林青玄負責。
設立暗堂，認命王錚為暗堂堂主，掌管玉泉門對外刺探，報收集，暗中監查，直接向掌門林青玄負責。
執法堂堂主柳依依，掌管宗門刑法，維護玉泉門門規，直接向掌門林青玄負責。
改組庶務堂，牛能仍為庶務堂堂主，設立靈獸司負責靈獸馴養，設任務司負責任務釋出與獎勵發放，設內務司負責修煉資源發放，獎勵兌換，雜役管理，各種大典籌辦等等，設外物司負責統籌資源開採，接受上交資源，修仙坊市管理等等。
改煉丹閣為煉丹，由三階下品煉丹大師丘平暫代主，改煉器閣為煉器，由三階上品煉器大師柳依依暫代主，改陣法閣為陣法，由三階上品陣法大師牛能暫代主，改制符閣為制符，由林青玄自己暫代主，每又下設諸多講師。
每每都有講師前去授課，每隔一段時間更有主親自授課，凡有意學習修仙技藝的弟子皆可前往聽課。
如此，四閣改四之後，四原本的權力幾乎去了九成。
之前的四閣制，算是將玉泉門的弟子分別歸屬到了四閣之下，四閣擁有調遣閣中弟子等諸多權力。
而四制，使得四隻有教授弟子和組織煉丹煉器，以及佈陣畫符的權力。
說白了，就是一個讓門下弟子學習的地方，任何弟子皆可去。
認命韓聰為暫時藏經閣閣主，十年之後再行更換。
藏經閣閣主不同於其他職位，需要長時間留在藏經閣內，但凡有追求的修仙者，基本都不會選擇鎮守藏經閣。
當年，林青玄去參加烈陽宗杜九孃的金丹大典時，心中就震驚於烈陽宗的功勳制度。
故而，此次他在玉泉門中設立功勳制度，弟子完成任務獎勵相應的功勳點，功勳點在玉泉門內取代原本的靈石，只要功勳點足夠，便可以從門中換取自己需要的寶物。
功勳點適用玉泉門的所有修士，上至掌門林青玄，下到雜役弟子都要遵循。
而功勳點的來源眾多，就任各個職位，完成各種任務，以及對玉泉門有貢獻的行為都將獎勵功勳點。
玉泉門的功勳制度由庶務堂負責，下屬四司分管。
功勳制度的出現，使得玉泉門在門派修仙勢力的道路邁出一大步，讓門中弟子對玉泉門更加依賴，增強了眾弟子對門派的認同感，呈現出了空前的團結。
林青玄定假丹期修士才可為長老，遂降柳依依，牛能，韓聰，姜穎，王錚丘平六人為執事，練氣期修士可為管事。
當然了，六人也只是名號從長老變成了管事，實際權利一點兒沒有少。
同時設立雜役，外面，內門，核心四等，核心弟子只設十人，首要條件便是六十歲前達到練氣九層，而單靈根與異靈根弟子必為核心弟子
硬規定築基期修士至少收徒三人，其弟子又可分為記名，普通，親傳三等，而築基期修士只能有一名親傳弟子。
不論年齡，不論修為，只要為親傳弟子便可以享受內門弟子的待遇，至於記名與普通弟子就沒有門派優待了。
隨著一系列的改革之後，玉泉門進入了飛速大發展時期。
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