額……
我只能說孩子你想太複雜了。或者說讀者的yy能力太過強大了。我以為我講清楚了，結果你們還是不清楚
作為作·者，我給主·角開的唯一的金手指就是那龐大的資料量，使得主角可以在第一卷大發神威。所以針對你的問題
1.在第一章中有交代，那龐大的資料量其實是後世一省的伺服器儲存量。我們知道，網際網路中的資料量每年都是以幾何速度翻倍的。所以二零一二年的一省資料量是足以匹敵一九九九年整個世·界的資料量的。至於小數之門可以使資料量增長，其實就是互相交流外加採集周圍資料形成小數之門自身的檔案資料，產生新的同質量的資料。但這種產量太少，所以越往後，數碼世界的資料量就會超過大數之門，這是必然的。
2.主角的資料型別不可見不可識別是建立在二零一二年的新型編碼器上的，在一九九九年根本沒有這麼新銳的解碼器，所以說主角的資料不可見不可識別不可破壞、但隨著時間和技術的發展，終有一日是會變成可以識別的。
3.關於古代賢者獸的目的，其實最開始我也想的很簡單，只是為了不讓十鬥士高自我犧牲那一套。後面我倒的確是想給他們加上一個偉大的目的
4.這和世界樹進化的目的有點關係，兩人貌似走在相同的道路上……具體的還沒怎麼想好。