萬萬沒想到，非但如此，漩渦長門陷入黑暗之中，暗中收集尾獸，企圖征服世界。
「老師」
長門也是艱難的開口道，喊出自己稱呼自來也的稱謂。
面對教導自己，愛護自己的老師，哪怕長門心墜地獄，一片黑暗，看到本應該殺死了的自來也老師，內心也是泛起一絲漣漪。
其實，他的心裡，遠不是他想象中的那樣，如同頑石一般堅定，好似地獄一樣黑暗。他內心深處還有一絲樂園，就是和彌彥、小南一起跟著自來也老師學習的日子。那是他自父母死後，有生以來最美好的回憶了。
雖然止水、鼬心裡有了準備，依然吃了一驚。這個古怪的男人，居然是三忍之一的自來也大人的弟子。
自來也苦笑一聲，回想起自己以前的日子。
真的好失敗呢！
同伴大蛇丸背叛並離開木葉，自來也曾阻止而未成功。但他一直期盼大蛇丸能回頭是岸，所以進行了長年對大蛇丸的追蹤。
自來也曾多次外出旅行，期間收了雨忍村孤兒彌彥、長門和小南為徒，在教了他們三年忍術後離開。
他寫書及年輕時四處遊歷的原因，是因為在妙木山修行時大蛤蟆仙人的預言，要他了解世界永珍及成為智者。
自己年輕的時候妙木山大蛤蟆仙人的預言。其中自來也問道：「老爺爺的預言，至今為止有沒有不準的？」通過大蛤蟆仙人的回答可以猜測出，自來也還是孩子的時候，在妙木山迷了路。然後大蛤蟆仙人給了他蛤蟆的力量並給了他預言。
其後，自來也得知「曉」首領佩恩及成員小南的真正身份，原來是自己第二次忍界大戰末期在雨忍村所收的徒弟。
千葉勸告自來也，不要輕舉妄動，等千葉準備好了。跟自己一起去雨之國，可是自來也有自己的打算。這是自己教匯出來的徒弟，怎麼能夠假借他人之手，幫自己除掉禍患。
自來也本想自己來承擔。但是，萬萬沒想到，自己居然不是徒弟漩渦長門的對手。甚至如果不是千葉的提醒，恐怕自己也無法活著回來。
就這樣，還是以斷了一個胳膊為代價。毀掉了對方一個佩恩。就是可是使用通靈術的那個佩恩。
自來也摸著大蛇丸移植給自己的那個柱間細胞構成的假肢，眼神複雜的看著長門。
當初，大蛤蟆仙人對自來也預言他會收一個獨當一面的孩子為徒，而這孩子會為忍界未來帶來空前的和平或毀滅，總會一天他就被迫要作出「選擇」他的選擇會將世界引向和平或者毀滅。
初時自來也以為眼前的佩恩，就是預言中的變革者，作出「選擇」的時刻也已經到了。故一場師徒之戰一觸即發。結果，也是顯而易見了。
而且自己也沒有救了老師，讓老師三代命隕於大蛇丸之手。
「長門。回頭是岸吧！彌彥可不想你變成這個樣子的！」
自來也苦口婆心的勸說道。
「其實你被騙了！」
「宇智波斑為了實行月之眼計劃，將輪迴眼移植於千手一族的遠親漩渦一族的後裔——幼年的你的身上，期望日後你能用外道·輪迴天生之術復活自己。而你長門，從此擁有了輪迴眼！」
「那個自稱‘宇智波斑’的人，並不是宇智波斑。宇智波斑在很久以前就死了。他叫宇智波帶土。是四代目火影波風水門的弟子。他也是收到了宇智波斑的蠱惑，從而對抗整個忍界！」
「呵呵呵呵……」
長門仰天冷笑一聲，寒聲道：「如果你說的都是真的。那麼我的一切都是經歷的都是假的了？！那麼彌彥的死，也是假的。他的道路，也是假的？！那麼我身上的痛苦，為何如此的真實！」