這類案件對袁世凱來說是拿手好戲，但對黎元洪來說還是第一次，而且是民國成立後的第一次。由於張振武有首義之功，更引起了人們的關切，軍法處地告示不僅不能消除人們的懷疑，反而更起了煽動作用。民眾的心理就是這樣，你越是遮遮掩掩、越是吞吞吐吐，他們就越認為你有問題。
黃興放了第一炮，通電譴責政府用不正當的手段擅殺革命有功人員，接著，共和黨參議員張伯烈等提出質問，要求政府提出張、方二人地確實證據，還有兩個武――孫武和蔣翎武，跑去見袁世凱，口口聲聲要求「免死券」，嗅到風聲的報界記者也格外興奮，紛紛往軍法處和總統府跑，誰都想從這裡掏出點爆炸新聞來……
「大總統，現在來問的人很多啊，我快要招架不住了。」趙秉鈞一臉謙恭地問道，「我們到底怎麼辦？」
「怎麼辦？你說怎麼辦？黎都督是讓我替他擔負責任的，千方百計要求我保守秘密。難道我就這樣說出去？」袁世凱放下報紙，不以為然地回答道。
「可如果硬挺著不說，對大總統的聲譽不利。」趙秉鈞向前一步，「現在各界議論紛紛，參議院都快吵翻天了。」
「是嗎？」袁世凱故作驚訝地回答。其實，他慣於以別人為工具，豈肯代人受過？之所以一時半會不丟擲黎元洪，是在等待合適的時機。
趙秉鈞看了袁世凱一眼。他知道袁世凱心裡在想什麼，但他不能說出來，他要順著袁世凱的心思說：「黎副總統發這個電報地意思很明確，確實要我們保密。按理說咱們應該遵照這個辦理，但這個事情現在鬧大了，不給外界一個明白地答覆，恐怕難以服眾。我倒是擔心大總統到時候會受到各方面的指責，這對於政局穩定是不利的。不如……不如……」
「那好吧。既然大家都很關心，我也就勉為其難，現在共和了嘛，大事確實要讓眾人知道。」袁世凱放下茶杯，「智庵。你去安排一下，就把黎副總統所有的電報都明明白白地告訴外界，不管是誰要證據，都找黎元洪要去。」
真電一齣。輿論大譁。18日，由張伯烈領銜，20人參議員聯合署名，正式向參議院提出，對黎元洪的電報進行全面批駁，認為全部是誣衊不實之詞，對黎元洪的違憲行為，極為憤慨；次日。參議院討論質問案，各黨參議員都對這一事件表達了譴責，同盟會參議員紛紛表示要彈劾政府，特別是要彈劾黎元洪、陸徵祥和段祺瑞。
袁世凱假惺惺地做了一番解釋，表面上看起來是為黎元洪推脫，實際上是在為自己推脫，他要的就是這個效果，你黎元洪不是想仿效我搞實力政治嗎？我就讓你嚐嚐參議員地炮火。讓你明白這不是那麼好學地。
議會外。譴責政府地活動越來越激烈，在袁世凱的有意引導下。人們把矛頭指向了黎元洪，21日，同盟會本部發布了開除黎元洪地啟事，指責他「擅殺元勳、破壞約法、動搖民國、人神共憤……」決定革去他同盟會協理併除名，後來又決定與其斷絕一切關係。
其它政團及知名人士也對黎元洪表示了極大的義憤。原本由黎元洪任社長的東西大同社，也以黎為「共和大敵」，與其脫離關係，將社名改為大同公社。
袁世凱對張、方二人本來並無成見，主要目的就是要離間黎元洪與革命黨人地關係，揭破他的政治陰謀，使其失去「忠厚長者」的偽譽，褪下「革命功臣」的光環，以便自己下手。直到成為千夫所指的過街老鼠，黎元洪才知道自己被袁世凱所賣，心情極其尷尬，以至於氣喘病復發，精神憔悴。但他既然做了，就不甘心就此認輸，哪怕錯了，也得硬著頭皮抗下去。他19日通電，開列張振武「十大罪狀」，僅僅過了兩天，又變成了十五大罪狀。極盡羅織之能事，無限上綱，將張振武描寫成十惡不赦、死有餘辜地罪犯，企圖以此來平息社會輿論，求得對自己的諒解。為了轉移視線，他還假惺惺地自認三罪，保證對張振武家優加撫卹，贍養其老母，開會追悼、親往祭奠，無所不用其極……
黎元洪還致電袁世凱，正式提出辭去參謀總長及湖北都督一職，並推薦黃興出任參謀總長，又向參議院提出辭去副總統職，一時間，整鍋水都被攪渾了，讓人分辨不清……
宋教仁從唐內閣的垮臺和陸內閣的風波中得出一個結論，同盟會要想反對袁世凱利用混合內閣把持權力，就必須建立一個真正強大地政黨，同時他還認為，眾多小黨的分立，不利於「和平競爭」，只有造就兩大黨對立，才能合乎民主原則，在他心目中，唯一有資格做同盟會對手的政黨只有人民黨。因此，同盟會要改組，加強自己的力量，而且是排除人民黨的改組。
但對於改組，同盟會本部的意見並不統一，很多人認為，在時局動盪時進行改組，無疑會動搖同盟會這塊招牌，甚至接連召開全體職員會和夏季大會後，多數會員仍然不同意宋教仁的主張，連蔡元培都表示「不能捨己從人，不能變更名稱」，同盟會圍繞著改組問題分成了兩派。但對宋教仁有利的是，他與贊成改組地孫毓筠、張耀曾等分別當選了總務、財政、政事部主任，改組派力量得到了加強。經過激烈的論爭，大多數會員被迫同意改組。
宋教仁首先將目光對準了統一黨，由於在陸內閣風潮中統一黨搖擺不定，受到共和黨和袁世凱的夾擊，讓他們覺得有與同盟會靠攏的必要，但即使這樣，統一黨也不同意無條件合併，談判一開始，谷鍾秀就提出三項先決條件：1、變更同盟會名義；2、廢除民生主義；3、改良內部組織。在雙方的談判過程中，以岑春煊為首的上海國民公黨也得知了這一訊息，派代表到北京表示願意參加。除同意統一黨的條件外，還額外附加了一條「取消男女平權」的要求。同盟會尤其是宋教仁為了求得合併地成功，對這些條件，原則上一律予以接受，但堅持在政綱中保留「民生」字樣。8月7日，三黨代表開會，就黨名和黨綱達成最後意見，是日，在北京地國民共進會和共和實進會兩個小政團也派代表與會，同意加入合併。8月11日，五黨代表開會，通過宣言，宣佈中國國民黨成立，準備半個月後召開正式成立大會。
國民黨宣佈以「鞏固共和，實行平民政治」為宗旨，以「保持政治統一、發展地方自治、勵行種族同化、採取民生政策、保持國際平和」為黨綱。將實行民生主義改為含糊的「採用民生政策」，將「力謀國際平等」改為毫無意義地「保持國際平和」，又不顧女同盟會會員的強烈反對，取消了「男女平等」的條文，妥協的氣氛在同盟會內部佔據了上風。