江陰被攻下來以後，明朝的老臣已經死了多半了。只有宜興、太湖、吳江、徽州等地，還有抗清的明臣。可也是實力孤弱，眼看也不行了。
宜興的瑞昌王盛瀝，是由盧象觀擁戴立為皇帝的。盧象觀秘密潛回南京，跟城內的同黨事先約定好，來作為內應。恰好洪承疇到了江南，查出奸細，就在城外設了埋伏。等到盧象觀率兵到來的時候，被伏兵給伏擊了。
盧象觀的兵，被殺得七零八落，連瑞昌王也被逮著殺害了。只有盧象觀奪路逃走，跑到了葛麟、王期昇那兒。
盧象觀剛到太湖，投降清朝的降將吳兆勝就已經奉洪承疇的命令率兵攻過來了。打了一仗，葛麟、王期昇的兵艦，都被清兵的火箭射中，兵艦順風就著，葛麟、王期昇等人趕緊跳到岸上逃跑。通城王盛澂，已經被火燒死了。
吳兆勝又去進攻吳江，半途中遇上了吳易的伏兵，被吳易殺得落荒而逃，兵船也被搶去了二十艘。
恰好貝勒博洛，從杭州北上，擊敗嘉興的徐石麟，趕跑了平湖的陳梧，沿途攻城掠地，直至打到吳江，正好遇上吳兆勝敗軍，兩路人馬聯合到一塊兒，又去攻打吳易。
吳易總以為吳兆勝已經被趕跑了，就沒有再防備。結果，被清兵四面圍住攻擊，清兵用炮轟，用火燒，將吳易的軍艦，燒得一個不留。
江南的民間隊伍，到這時候基本上已經都完了。於是，洪承疇就派遣都統葉臣，總兵張天璜去進攻徽州。
原來明朝的僉都御史金聲，正在招募民間隊伍，安排人手，分別駐紮在戰略要地。又聯絡原來的巡撫邱祖德、職方郎中尹民興、推官溫璜吳應箕等人，作為友軍，相互支援，並派人去報告了福州唐王。這時候，唐王已經在福州稱帝，年號隆武。
新皇帝收到金聲的信，非常高興，立刻任命他為右都御史，兼任兵部右侍郎總督諸道兵馬。金聲也是感恩圖報，先後攻下了旌德、寧國等地，立即名聲鵲起。
可惜，老天不肯幫忙，又遭小人暗算。清兵從小路經過叢山關，直接趕到績溪，繞到了金聲的背後，金聲趕忙派人去救援，正跟清兵相持不下的時候。忽然來了臭不要臉的黃澍，這傢伙是個偽君子，口口聲聲說要恢復明朝，金聲也認為這傢伙靠得住，可以共赴國難，沒想到這傢伙竟然暗地裡串通好了清兵，趁著晚上開啟了城門，把清兵給放了進去。
一幫子人，被殺的殺，被擒的擒，僅逃走了尹民興一人。被抓的人裡面，有一個叫江天一的，他是金聲的得意弟子，這傢伙很有才。他見了洪承疇，說洪承疇是個死人，然後把崇禎給洪承疇寫的祭文背了出來。洪承疇惱羞成怒，把逮著的人全部給殺害了。
這時建昌和撫州，已經被投降清朝的金聲桓帶兵攻下來了。益王朱由本、永寧王朱慈炎也都在逃跑的路上掛掉了。長江上下游基本上已經平定了，捷報紛紛傳到北京，一臉鬱悶的多爾袞才略微有點好臉色。
明朝只有魯王和唐王，仍然盤踞在浙閩一帶，留著總是禍害，不能不去攻打。正想讓豪格去，恰好有土匪張獻忠盤踞在四川，燒殺淫掠，無惡不作，百姓四處逃難，紛紛向清政府求救。
多爾袞立馬藉著這個機會，任命豪格為靖遠大將軍，讓他帶領著平西王吳三桂等人去平定四川。浙閩的軍事問題，仍然讓博洛去攻打，封了他個徵南大將軍，讓他帶領著都統圖賴和貝子屯齊，再南下杭州。
博洛奉命南下，又回到了杭州。這時候，聽說魯王和唐王正在起內訌，進行大火拼，這可是喜上眉梢的大好事兒。魯王和唐王怎麼一家人不認一家人了？
原來，唐王是叔，魯王是侄子，唐王想讓魯王稱臣，他自己做皇帝。於是，就派人帶了十萬兩銀子，特地去犒勞浙東軍士，結果魯王不要。魯王不要也就罷了，偏偏這銀子讓方國安給搶去了。這下，叔侄倆才真成了仇家。
博洛聽到這個訊息，正好趁機攻打。立刻帶兵渡錢塘江，剛渡到一半，突然颳起了東南風，遠遠地過來一艘乘風破浪的大船，船上站著一位旗幟鮮明的大將軍，這人正是原明朝的兵部尚書張國維。兩軍很快戰到了一塊兒，沒一會兒的工夫，博洛的坐船就被明軍的炮彈打了一個大窟窿。他嚇得趕緊回了岸，清兵也趕忙跟著，上岸回城了。
張國維乘勝追擊，一路攻到城下，賣力猛攻。忽然，有人報告說方國安簇擁著魯王已經到了東岸邊，張國維沒辦法，只好停下回去迎接，暫時休息。恰好馬士英、阮大鋮兩個人也去了方國安的軍營，方國安和他倆是臭味相投，就在魯王面前大力推薦，把這倆壞種送到浙東了。又請求把張國維調走去鎮守義烏。張國維一去，清兵又用船運大炮，大舉渡江。
方國安不敢抵抗，準備投降清朝，並陰謀把魯王弄去當獻禮。幸虧這魯王還比較警覺，一個人悄悄溜了。一直跑到石浦，碰到原明朝的定西侯張名振，和他一塊兒渡海東去了。方國安就率領著馬士英、阮大鋮等人，一塊兒跑到清營投降了。
阮大鋮又領著清兵去進攻金華，金華城防守不是很森嚴，被清兵用炮轟進去了。原明朝大學士朱大典也全家遇難。
清兵又去攻打義烏，張國維帶兵堅決抵抗，可惜勢單力孤，堅持了幾天也頂不住了。張國維知道怎麼也打不過，就寫了三首詩，然後跳河自殺了。
清兵攻下義烏，緊接著去攻打衢州，原明朝知府伍經正等人以身殉國。浙江已經被平定了，博洛又率兵去攻打福建，眼看著唐王也要完了。
唐王鎮守福建，還比較積極進取，不像以前的弘光帝那麼好色混蛋。他宮裡也沒什麼美女小妾，只有老婆曾氏。曾氏知書達禮，是一位賢內助。當時，長江下游的民間組織都已經被消滅了，只有楊廷麟仍然堅守贛州，被唐王封為兵部尚書。還有原明朝湖廣總督何騰蛟，收納了李自成的殘兵敗將，和原明朝湖南巡撫堵胤錫，一起給唐王寫信，爭取恢復祖國大業。唐王封何騰蛟為定興伯，兼任東閣大學士，封堵胤錫為兵部右侍郎，兼任右僉都御史。
何騰蛟請唐王轉到湖南去，結果被鄭芝龍他們給阻止了。鄭芝龍本來是個海盜，崇禎年間才投降明朝，他平定海盜有功，被明朝提拔封為南安伯。他仗著擁戴有功，自己又有兵權，就要挾唐王。唐王沒有辦法，只好讓大學士黃道周到關外去招兵買馬，作為自己的護衛隊。
黃道周手無寸鐵，只帶著幾個手下人去關外招兵，一直走到婺源。結果被洪承疇的偵查員給偵查到了，被半路截獲。
黃道周忠誠堅韌，當然不像洪承疇一樣，他從容地寫了首絕命詩，放到自己的口袋。要砍頭的這一天，路過東華門，黃道周站住不走了，說：「這兒離著高皇帝陵很近，就在這兒動刑吧。」
負責砍頭的人也為他的忠誠所感動，於是就在東華門外行了刑。他的手下賴雍、蔡紹謹、趙士超等人也都英勇就義。
唐王聽說黃道周遇難，大哭了一場，決定冒險去湖南。於是，他從福州出發，一直抵達延平。
這時，楊廷麟也已經派人去迎接了，哪知道半路上鄭芝龍派人去阻攔，非要把唐王留在福建，說是自己去出關迎敵。唐王只好送他出關。鄭芝龍一到關外，正好趕上洪承疇招降，答應封他個侯。這傢伙立馬騙唐王說，有海盜入侵，他去抵擋。守衛的將士都跟鄭芝龍走了，仙霞嶺上一個守軍也沒有了。貝勒博洛就從衢州出發，帶兵過仙霞嶺，長驅直入。