神農氏在詳細地瞭解了軒轅之後，得知對方有大智慧、大能力，背後又有闡教的支援，便決定將人皇之位傳於軒轅。

有此決定神農氏便很快便開始安排人皇交接的儀式，神農氏的這個決定讓本部落的族人有些感到不滿，人族發展到現在這個階段，他們已有了尊貴的分別，新任人皇不是出自他們的部落，這對部落的聲望是有所影響。可惜神農氏為人皇，他這決定是不可更改的。族人們也只能遵從他的命令，開始準備交接的儀式。

軒轅在得知人皇神農氏將傳位於自己，心中十分高興，感覺自己終有施展抱負的一天了，他所在的風充部落也是歡天喜地、熱熱鬧鬧。

這一日，天氣晴朗，太陽高照，人族各個部落的首領都接到了人皇神農氏的傳訊齊聚於一堂，來見證人皇的交接儀式。

在傳位大典那天，天空之上也來一架九龍輦，九龍輦旁邊正是玄都大法師，說道：「神農今日功德圓滿，特冊封為地皇，隨天皇伏羲一起前去那三十三天外火雲洞一起修行。」天皇伏羲乘著九龍輦車前來，只對著神農拱手笑道：「恭喜皇弟得以功德圓滿！」

神農氏便正式宣佈軒轅接替他的職責，就任下一界人皇，把代表人皇地位的天地印送給軒轅。人族各部落的首領與上任人皇伏羲，玄都大法師、燃燈道人、多寶道人、女媧弟子金寧和天庭真武見證下，他們完成了人皇的交接，自此人族進入了人皇軒轅的時代。

神農氏退位，天降巨大的功德，不過這次功德之大出乎了眾聖的意料，差不多有伏羲所得功德的兩倍之多，由此可見神農氏為人族付出了多少的汗水。功德八份進入了神農體內，兩份則飛到凌霄殿昊天體內。昊天頭頂龍氣翻滾，九千九百九十九條天龍猙獰咆哮，穿梭雲海間，盡顯大帝之威嚴和風采，腦後一輪畝田大小的功德金輪射出道道金光。

功德入體後神農氏的修為瞬間提長到了準聖大圓滿，成就了人皇道果。神農被這從天而降的功德一下子將道行提高到深不可測的地步瞬息之間就明白了自己乃是應天命而生，順應道家之意，顯化牛，託生人族，為人教大興的推動者，順應天機，得享壽福，獲此無量功德，從此當不生不滅，安度無量量劫而不夾！

九聲龍吟響起，將還在沉思中的神農驚醒，就見天際有九頭身姿矯健俊美的神龍拖著一車輦而來，通體異香，用珍稀木材沉香木打造九條神龍呈現赤橙黃綠青藍紫外加黑白二色，清氣托足，瑞氣相隨，紫霧騰騰，彩煙迷濛，九條俯，靜候神農。

玄都大法師則說道：「神農氏既然成就人皇道果，便可前往火雲洞中修煉，以後不得插手洪荒中事。」

神農氏點點頭，同意了玄都大法師的提議，然後起身與伏羲一起一起跨九龍輦車前往火雲洞。

軒轅繼位人皇，將原來的風充部落正式更名為有熊部落。元始天尊在軒轅繼位人皇后是眉開眼笑，十分高興，將門下弟子全數派到軒轅身邊，幫助軒轅治理天下。於是，闡教藉著人皇的優勢，逐漸在人族興盛起來。